【blast安装及使用】如何在Linux配置blast做序列对比

本文提供了一步一步的指南来帮助读者在Linux环境下安装并配置Blast+工具。内容包括从官方FTP站点下载预编译的Linux版本、解压缩文件、移动至指定目录、更改目录名称以及设置环境变量等关键步骤。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

  下载文件路径:https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/
  选择预编译的linux版本

下载命令

wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz

对文档解压

tar -zxvf ncbi-blast-2.2.30+-x64-linux.tar.gz

将其移至自己想要的安装目录中

mv ncbi-blast-2.2.30+ 自己的目录路径 # 移动
cd 自己的目录路径                    # 进入本地进程安装路径
mv ncbi-blast-2.2.30+ blast        # 修改目录名

需要将blast+的路径加入到环境变量中,方便以后的调取
可以用 vim 编辑器,在 ~/.bashrc文件 输入如下所示:
按 i 进入输入模式,在最后加入以下行:

export PATH=自己的路径:$PATH

按 esc 退出输入模式,进入命令模式。输入 :wq 保存并退出
使之生效

source ~/.bashrc

验证

blastn -version

参考文献

[1]生信基础 | 使用BLAST进行序列比对
[2]Linux安装blast+及使用
[3]Linux解压文件出现错误
[4]Linux下BLAST的安装与使用
[5]Ubuntu 下Blast+工具的安装与环境配置

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值