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技能树学徒作业
文章平均质量分 77
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热爱医学,执着科研。公众号:生信方舟
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单细胞水平看生存分析相关基因
针对每个癌症的全部基因批量了做了单基因的cox分析,挑选统计学显著的去对应的癌症去打分,看看是否有单细胞亚群特异性。原创 2024-07-02 09:20:23 · 674 阅读 · 0 评论 -
转录组数据提取技巧汇总
数据整理是数据分析的前提,而数据的正确提取则是数据整理的前提。原创 2024-05-26 19:26:51 · 594 阅读 · 0 评论 -
一套代码即可搞定常见的单基因基础分析
如何能够像网页工具一样,仅输入基因名称,通过一套代码就可以获得基因表达量在不同样本中的表达量差异图,基因表达量差异与临床病理参数之间的关系图以及表达量差异与生存的关系图呢?原创 2024-05-20 09:14:28 · 790 阅读 · 0 评论 -
生信游民作业—给学徒的GEO作业1(更好看的箱线/小提琴/点图)
更好看的箱线/小提琴/点图原创 2024-05-15 20:34:19 · 1023 阅读 · 0 评论 -
生信游民作业—两次差异分析结果交集需要有多大才算是一致呢(第二部分)
理论上,任意疾病或者其它实验设计,都是可以找到多个数据集,它们各自可以独立差异分析。然后,使用下面的统计学方法和工具来进行比较:1.Jaccard相似性指数;2.Pearson相关系数;3. Spearman秩相关系数;4. Venn图;5. Gene Set Enrichment分析(GSEA); 6. 差异基因列表重叠分析; 7. 回归分析。原创 2024-05-09 20:52:27 · 338 阅读 · 0 评论 -
生信游民作业—两次差异分析结果交集需要有多大才算是一致呢(第一部分)
理论上,任意疾病或者其它实验设计,都是可以找到多个数据集,它们各自可以独立差异分析。然后,使用下面的统计学方法和工具来进行比较:1.Jaccard相似性指数;2.Pearson相关系数;3. Spearman秩相关系数;4. Venn图;5. Gene Set Enrichment分析(GSEA); 6. 差异基因列表重叠分析; 7. 回归分析。原创 2024-05-08 22:15:22 · 381 阅读 · 0 评论