同位素标记脱氢丙氨酸(Dha)

        氢丙氨酸(Dha)是一种天然存在的氨基酸,它可以通过半胱氨酸(Cys)衍生生成。因此认为蛋白中的Cys转化为Dha后,Dha中的α,β不饱和的酰胺捕获重水中亲电D+,随后再与硫醇化合物发生迈克尔加成反应,可实现蛋白质位点选择性的无痕氘代标记。为了使Dha与硫醇化合物S-R反应能够得到Cys的产物,测试了R=H, Ac和PO32-等时化合物的反应活性和脱保护情况, 发现磷酸化的硫醇化合物均能成功地反应插入和脱保护。先在组蛋白H3的10号Cys位点H3-Cys10进行验证,利用双烷基化的脱除试剂DBHDA将Cys转化为Dha,随后H3-Hda10在重水环境下与Na3SPO3反应生成H3-[d1]Cys10–S–PO32-,分别可以通过磷酸酶PP1或酸环境脱除磷酸根,得到H3-[d1]Cys10, 其中酶水解1 h后的产率>95%。得到的产物在α位置存在差向异构,其中L:D的比例在1:2。也同样在H3的26号Cys位点H3-Cys26进行了同样的反应,也实现了位点选择性的氘代标记。

之前开发的DBHDA试剂可以高效选择性在蛋白中的Cys进行脱除反应生成Dha,然而其中的机制却不清楚,进一步利用这种氘代标记研究了Cys转化为Dha中的蛋白化学反应机理。先探究了与蛋白中的Cys反应生成的硫叶立德反应中间体的稳定性以及对随后的C-H交换反应活性的影响。发现中间体发生消除反应生成的Dha的过程中硫叶立德的生成和相应位点的脱除是密切相关的。还通过密度泛函理论对DBHDA将Cys转化为Dha过程的可能的过渡态能量进行计算,发现了在消除反应过程中硫叶立德中间体可能存在Swern-like分子内脱质子过程。

总之,开发了一种翻译后位点选择性无痕的氘代标记技术,并利用这种技术研究了蛋白质化学中的双烷基化的脱除试剂DBHDA将Cys脱除转化为Dha的机理。

CAS号    中文名称      英文名称

14132-51-5 苯甲醛-D5 Benzaldehyde-d5

39091-63-9 溴代异丙烷-D7 2-Bromopropane-d7

1455-13-6 甲醇-D1 Methanol-d1

4165-57-5 溴苯-D5 Bromobenzene-d5

865-50-9 碘甲烷-D3 Iodomethane-d3

53170-19-7 二甲胺盐酸盐-D6 Dimethyl-d6-aminehydrochloride

106658-09-7 2-氨基丙烷-D7 Isopropyl-d7-amine

215527-70-1 苯硼酸-D5 Phenyl-d5-boronicacid

68375-92-8 1,4-二溴丁烷-D8 1,4-Dibromobutane-d8

4165-62-2 苯酚-D5 Phenol-d5

13127-88-3 苯酚-D6 Phenol-d6

3675-63-6 溴乙烷-D5 Bromoethane-d5

4165-61-1 苯胺-2,3,4,5,6-D5 Aniline-d5

6485-58-1 碘乙烷-D5 Iodoethane-d5

4165-56-4 对二溴苯-D4 1,4-Dibromobenzene-d4

314062-45-8 哌嗪-D8二盐酸盐 Piperazine-2,2,3,3,5,5,6,6-d8dihydrochloride

917358-65-7 N-甲基哌嗪-2,2,3,3,5,5,6,6-D8 N-Methylpiperazine-d8

285132-87-8 二乙胺盐酸盐-D10 Dityhyl-d10-animehydrochloride

152404-47-2 4-羟基苯甲酸-D4 4-Hydroxybenzoic-2,3,5,6-d4acid

25725-11-5 叔丁醇-D9 2-Methyl-2-propanol-d9

101927-33-7 2-碘丙烷-D7 2-Iodopropane-d7

102867-56-1 2-(2-羟基乙氧基)乙醇-D8 2-(2-Hydroxyethoxy)ethanol-d8

102910-31-6 正丙醇-D7 N-Propanol-d7

103963-58-2 1,2-苯二酚-3,4,5,6-D4 1,2-Benzene-3,4,5,6-d4-diol

1079-02-3 苯甲酸-D5 Benzoicacid-2,3,4,5,6-d5

1173020-64-8 4-溴苯甲醛-D4 4-Bromobenzaldehyde-d4

1189723-14-5 1-甲基-4-哌啶酮-2,2,6,6-D4 1-Methyl-4-piperidone-2,2,6,6-d4

1219802-81-9 苄胺-D5 Benzyl-2,3,4,5,6-d5-amine

1219803-98-1 庚酸-D5 Heptanoicacid-d5

1257654-84-4 三乙氧基硅烷-D1 Triethoxysilane-d

1259188-37-8 三(2-乙基己基)磷酸酯-D51 Tris(2-ethylhexyl)phosphate-d51

1335401-17-6 丁香酚-D3 Eugenol-d3

134071-64-0 叔丁胺-D9-盐酸盐 tert-Butylamine-d9hydrochloride

14493-42-6 丁二酸-2,2,3,3-D4 Succinicacid-d4

1628788-85-1 3-(苯基-2,3,4,5,6-D5)-9H-咔唑 9H-Carbazole,3-(phenyl-2,3,4,5,6-d5)-

17901-93-8 苯甲醛-D6 Benzaldehyde-d6

19136-91-5 甲基乙酸-2,2-D2 Propionic-2,2-d2acid

191656-33-4 对氯苯胺-D4 4-Chloroaniline-d4

202529-13-3 3-甲基吡啶-D7 3-Methylpyridine-d7

2036-39-7 噻吩-D4 Thiophene-d4

2199-69-1 1,2-二氯苯-D4 1,2-Dichlorobenzene-D4

2199-72-6 1,2,4-三氯苯-D3 1,2,4-Trichlorobenzene-d3

2219-51-4 乙二醇-D4 Ethylene-d4glycol

223134-74-5 异丁酸-D7 2-Methylpropionic-d7acid

2256741-79-2 1-Boc-4-(4-氨基苯基)哌嗪-D8 1-Boc-4-(4-aminophenyl)piperazine-d8

22581-63-1 1,2-二溴乙烷-D4 1,2-Dibromoethane-d4

25493-14-5 1-碘丙烷-D2 1-Iodopropane-d2

28077-64-7 苯乙酮-D5 Acetophenone-d5

28106-59-4 苯甲醛-D Benzaldehyde-d1

284474-52-8 4-羟基苯甲醛-2,3,5,6-D4 4-Hydroxybenzaldehyde-d4

284474-81-3 氨基乙烷-D5盐酸盐 Ethyl-d5-aminehydrochloride

288400-96-4 苯丙酮-D10 Propiophenone-d10

29054-08-8 异丁酸-D6 Isobutyric-d6acid

30994-23-1 琥珀酸二甲酯-2,2,3,3-D4 Dimethylsuccinate-d4

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