小分子Asp/Glu/Lys/Ser/Thr/Tyr和喹酮甲基化PQM蛋白交联剂

小分子Asp/Glu/Lys/Ser/Thr/Tyr和喹酮甲基化PQM蛋白交联剂

小分子Asp/Glu/Lys/Ser/Thr/Tyr和喹酮甲基化PQM蛋白交联剂

小分子交联剂对于探测生物分子间的相互作用和在处理大型蛋白复合物和内在无序蛋白时的交联质谱(CXMS)是非常宝贵的。现有的化学交联剂只针对一小部分氨基酸残基，限制了交联的数量和类型，而传统的光交联剂几乎不选择性地针对所有残基，使数据分析变得复杂。

设计合成了基于光保护的喹酮甲基化(PQM)的一系列交联剂，能够通过特定的Michael加成靶向9个亲核残基。除了Asp、Glu、Lys、Ser、Thr和Tyr外，PQM交联剂还显著地交联了Gln、Arg和Asn，迄今为止，这些化学交联剂还不能作为靶点，用单一交联剂显著地增加了靶点残基的数量。

 

较初设计了一种含NHS酯基和光保护ortho-QM(o-QM)的双功能交联剂NHQM。邻硝基苄基在酚羟基上的邻位甲基上连接了两个氟原子，当加入到蛋白中时，NHS会很快和暴露的Lys残基反应，将光保护的o-QM放置在相互作用蛋白的残基旁边，o-硝基苄基在紫外线照射下被清除，生成o-QM，并与附近的亲核侧链发生交联。

为了增加交联剂的灵活性，还合成了NHQM3C，在NHQM的spacer 中添加了三个亚甲基