Bray-Curtis距离

Bray-Curtis距离是以该统计指标的提出者J. Roger Bray和John T. Curtis的名字命名的，主要基于OTUs的计数统计，比较两个群落微生物的组成差异。与unifrac距离，包含的信息完全不一样；相比于jaccard距离，Bray-Curtis则包含了OTUs丰度信息。

bray-curtis距离
其中，S_(A,i)和S_(B,i)表示第i个OTU分别在A群落和B群落中的计数。min表示取两者最小值。

举例说明：
群落A和群落B的OTU统计如下表，

community OTU1 OTU2 OTU3 OTU4 OTU5
A 10 8 4 1 1
B 7 3 8 4 0

min(S_(A,i)，S_(B,i)) = 7+3+4+1+0 = 15

sum(S_(A,i)) = 10+8+4+1+1 = 24
sum(S_(B,i)) = 7+3+4+8+4+0 = 22

D = 1 - 2*15/(24+22) = 0.3478

当然，D值越小越好，表示二者组成差异小。