[R]提高R语言速度

前言：R语言在聚类中应用广泛，所以我义无反顾的选择它。但实验室就我1个人用，网上资料也很少。是时候针对走过的弯路和曾有过的探索，总结一番。

1.     参考《R语言编程艺术》(Norman Matloff)

chapter 14 & chapter 15

2.     方法

（1）向量化 

与非向量化-循环做个对比：

（2）R中调用C或cpp

通过Rstudio建立R包，R包中可以联合使用cpp。仅拿循环做个例子，cpp中做循环的速度秒杀R。

查看R包的源文件，可以发现许多R包其实是用了.cpp的！

（3）多线程

若在Rgui中直接运行程序，1个核跑1个Rgui；若电脑有4个核，就可以开4个Rgui跑4个程序。

使用多线程，就能多核运行了，算法运行时间必然缩短。

可以通过任务管理器观察cpu的运行情况。

对于4核系统，开3个还是4个线程呢？若开4个线程，cpu占用