基于qiime1进行HUMAnN2分析通路（亲测可行）

HUMAnN2是由Huttenhower组发布的，基于全基因组测序数据用于计算基因丰度的软件。
该工具也可以用于PICRUSt数据将KEGG genes重建为KEGG pathways。在我们处理我们的16S数据之前，我们首先需要安装HUMAnN2和HUMAnN（之前的版本）。
Step1:通过pip安装HUMAnN2

conda activate qiime1#我的qiime1环境
pip install humann2

Step2:下载HUMAnA的安装包并解压。你只需要从文件中获取一个文件：humann-0.99/data/keggc。运行下列代码或者手动下载包并解压：https://bitbucket.org/biobakery/humann/downloads/humann-v0.99.tar.gz

#下载至本地

wget ~/ https://bitbucket.org/biobakery/humann/downloads/humann-v0.99.tar.gz

#解压该压缩包
tar -zxvf ~/humann-v0.99.tar.gz
Step3:a.建立新的文件存储临时文件

mkdir split_files #存储临时文件
mkdir humann2_out # 存储由HuMAnN2产生的文件
mkdir humann2_tables # 存储最终的表格
Step3:b.将PICRUSt的宏基因组预测表格（.biom）拆分成单个的biom文件