OR值的全称是oddratio,又称比值比,对于发病率很低的疾病来说,它是OR值即是相对危险度的精确估计值。
计算公式如下:
Odd ratio, 95%CI
假定我们要鉴别一个基因(或者标记位点SNP)有两个等位基因(等位):记为
Allele 1 | Allele 2 |
| Allele1 | Allele2 |
病例 | A | B |
对照 | C | D |
odds 值在病例和对照可以计算如下:
病例Allele1Odds
对照Allele1Odds
那么在这一点Allele1的OR值可以计算如下:
同样的,95% Confidence Intervals (CIs)值可以计算如下:
95% CI of ln(OR) = ln(OR)±1.96(1/A+1/B+1/C+1/D)0.5
95% CI of OR = e95% CI ofln(OR)、
logistic回归中,OR值=1,表示该因素对疾病的发生不起作用
ln(OR)近似服从正态分布,因此在计算OR值置信区间的时候都是先计算ln(OR)置信区间,再计算OR置信区间(参考:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1127651/,http://bioterrorism.slu.edu/bt/products/bio_epi/scripts/mod12.pdf,http://www.sjsu.edu/faculty/gerstman/StatPrimer/case-control.pdf)
参考资料1(维基):http://en.wikipedia.org/wiki/Odds_ratio#
定义:Definition interms of group-wise odds
Ifthe probabilities of the event in each of the groups arep1 (first group) andp2 (secondgroup), then the odds ratio is:
whereqx
参考资料2:http://www.bioinformatics.org/snp-tools-excel/
例子1:
例子2:
http://www.blackwellpublishing.com/specialarticles/jcn_10_268.pdf
参考资料4:http://intmedweb.wfubmc.edu/ebmreviews/odds.html
参考资料5:http://hydra.usc.edu/scehsc/pdfs/D-1-3-3lesson calculating odds.pdf参考资料6
参考资料7:
博文来源于:http://blog.sina.com.cn/s/blog_4af3f0d20100b9dh.html~type=v5_one&label=rela_nextarticle