今天给同学们分享一篇孟德尔随机化+转录组的生信文章“Exploring the causality and pathogenesis of systemic lupus erythematosus in breast cancer based on Mendelian randomization and transcriptome data analyses”,这篇文章于2023年1月16日发表在Front Immunol期刊上,影响因子为8.786。
乳腺癌是全球女性最常见的癌症,与慢性炎症密切相关。由于女性中SLE的高发病率,积累的观察性或队列研究已经探讨了SLE和乳腺癌之间的关联。然而,观察性研究得出了相互矛盾的结论,因为结果可能受到许多潜在混杂因素的影响,包括样本大小和抗SLE免疫抑制治疗。SLE和乳腺癌的流行病学模式在不同种族人群之间也可能有所不同。因此,需要采用更加精心设计的方法来评估系统性红斑狼疮与乳腺癌风险之间的因果关系。
图1 研究设计概述
1. SNP的选择
总的来说,这项研究分析了共计243,218名欧洲血统个体(128,178例患者和115,040例对照