研究发现PDRG1在多种癌症中表达异常，与患者预后、免疫细胞浸润、m6A甲基化及TMB、MSI相关，可能是泛癌生物标志物。
今天给同学们分享一篇单基因泛癌+甲基化+免疫浸润的生信文章“A pan-cancer analysis of the expression and prognostic significance of PDRG1”，这篇文章于2023年1月31日发表在Ann Transl Med期刊上，影响因子为3.616。
PDRG1参与细胞的多种生理调控，包括细胞增殖、生长、凋亡和细胞周期调控，但它们在癌症中的作用尚未得到明确研究。
1. 肿瘤中PDRG1的表达
作者首先分析了TCGA数据库中33种组织和相邻组织中PDRG1的表达差异。结果显示，PDRG1在不同癌症类型中表达上调、下调或不变（图1）。PDRG1在膀胱尿路上皮癌（BLCA）、乳腺浸润性癌（BRCA）、胆管癌（CHOL）、结肠腺癌（COAD）、食管癌（ESCA）、头颈部鳞状细胞癌（HNSC）、HNSC−HPV阳性、肾嗜酸性染色体瘤（KICH）、肾透明细胞癌（KIRC）、肾乳头状细胞癌（KIRP）、肺腺癌（LUAD）、肺鳞状细胞癌（LUSC）、直肠腺癌（READ）、胃腺癌（STAD）和子宫体内膜癌（UCEC）中显著上调。在KIRC和甲状腺癌&#x
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