差异miRNA转录因子预测

最新推荐文章于 2024-09-13 15:35:01 发布
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本文讨论了在信息技术驱动的内容社区中，技术专家如何利用数据进行深入分析，以支持社区运营和发展策略的制定。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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提供数据，我负责分析。

 

杏林小菜鸡
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miRNA数据库篇——TransmiR:转录因子和miRNA调控关系数据库
小糖同学的专栏
04-08 4435
TransmiR:转录因子和miRNA调控关系数据库 mRNA可以翻译成各种功能的蛋白，其中有一类研究调控蛋白研究的非常火热，即转录因子transcription factor, 简称TF,TF参与调控转录起始过程，是研究转录调控必不可少的一环。miRNA可以与mRNA结合，发挥转录后调控功能, 二者都是生物体内调控网络中的重要组成部分。 对于生物体内的调控关系，研究的比较多的是TF-mRNA, ...
New Phytol | 植物miRNA-转录因子-靶基因模块调控网络如何构建
Igenebook的博客
07-05 854
GmMYC2在GmARF16-OE植株中的表达有较强的上调，表明大豆耐盐性可能受到GmARF16依赖的GmMYC2诱导的调控。然后，研究检测了GmARF16的编码区，并评估了它们的激活能力，由于G-A的替代，导致了不同的转录活性。随后，作者进行ChIP-qPCR、EMSA、LUC实验，结果支持了GmARF16可以通过直接与其启动子中的NNGACA基序结合来激活GmMYC2的解释，这与miR160a-GmARF16-GmMYC2模块在调节大豆耐盐胁迫中发挥作用的假说相一致。这类研究，都可以参考如下思路。
HGIMDA：用于miRNA-疾病关联预测的异构图推断
xhxxx
02-25 2480
英文标题：HGIMDA: Heterogeneous graph inference for miRNA-disease association prediction 论文链接：https://www.researchgate.net/publication/305719244_HGIMDA_Heterogeneous_graph_inference_for_miRNA-disease_association_prediction 摘要 最近，microRNA（miRNA）受到越来越多的关注...
miRNA的特征、功能及识别方法等详解
热门推荐
高锦的博客
09-06 3万+
miRNA的特征、功能及识别方法等详解
miRNA数据分析专题
庐州月光的博客
11-30 2495
欢迎关注”生信修炼手册”!miRNA是一类长度在18到36bp的非编码RNA, 其功能属于转后后修饰调控，主要通过和mRNA的3’UTR区进行结合，结合区域称之为`seed`，当结合区域...
文献学习笔记丨转录组表达数据的生信挖掘研究
青笋的博客
09-11 1556
基因的表达是一个非常重要的过程，转录组测序是检测基因表达的技术，本篇文献对转录组分析流程和数据分析方法进行介绍。 引言 基因表达特征：时空特异性转录层面研究基因表达的技术：PCR、基因芯片、转录组测序（RNA-seq）、Nanostring等高通量技术：检测样品中的大量基因表达情况，目前的热门研究领域。关键词：转录组、生信、数据发掘 大规模转录组数据 常规转录组测序 转录组是一个细胞或者样本中全部的基因表达转录本信息，研究转录组是解析基因组中功能元件和生命活动的发生及调控机制的必要基础。 普通转
【生物信息学】外泌体miRNA成长训练营(14天）
Everyday try to become better -Kobe Bryant
07-15 558
现阶段，miRNA的研究已经进入了白热化时代，不管是什么研究方向，科研者皆是熙熙攘攘，这也致使miRNA研究越来越难冲击高分文章。所以江湖传言，miRNA似已过时。其实，这并非事实，而miRNA作为科研新手之友，从SCI灌水到冲击10分大关，它都有套路可以学。所以本期《miRNA研究套路课》训练营依旧秉着“文章模块化拆解”的核心思想，剖析经典文献范例，以便总结出miRNA研究的标准配备模板。....................................
文献解读|miRNA与多组学联合分析阐明花生花青素合成新机制
weifanbio的博客
05-18 744
TITLE：Multi-Omics and miRNA Interaction Joint Analysis Highlight New Insights Into Anthocyanin Biosynthesis in Peanuts（Arachis hypogaea L.） 译名：miRNA与多组学联合分析阐明花生花青素合成新机制 期刊：Frontiers in Plant Science 日期：2022年2月 下载链接： https：//doi.org/10.3389/fpls.2022.818345
经典入门 | 高级转录组分析和R数据可视化 （2024.9）
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
06-03 435
福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现安排《高级转录组分析和R数据可视化》于2024年9月20-22线上/线下课程 (线上课是通过腾讯会议实时直播线下课，实时互动，并录制有视频回放，无限期观看)。报名参加线上直播课的老师可在365天内选择参加同课程的一次线下课。期待和大家的线上线下相识。相关课程转录组线上/线下开课时间：2024/9/20-22扩增子线上/线下开课时间...
miRNA与癫痫的研究进展
02-26
例如，miR-146a在癫痫模型和患者的海马区明显上调，这可能与其调控白介素1β（IL-1β）及炎症相关转录因子NF-κB的表达有关。 近年来，研究人员已经开始关注miRNA在癫痫中的潜在应用，包括它们在疾病诊断、预后评估...
"ALS血脑共同基因差异表达及转录因子microRNAs影响研究
于二零一九年一月十六日（二零一九年）100193肌萎缩侧索硬化症患者血细胞和脑组织共同的马里兰州Rezanur Rahmana，J.，1，Tania Islamb，1，Fazlul Huqd，Julian M.W.奎恩·C，Mohammad Ali Monid，穆罕默德aKhwaja ...
预测STAD和LIHC新型miRNA生物标志物：计算机模拟方法
医学信息学解锁24（2021）100581预测STAD和LIHC诊断和预后分析的新型miRNA生物标志物候选物：一种集成的计算机模拟方法Kumkum Kara，1，Atqiya Farihaa， 1，Md Shahadat Hossaina，**，Mahafujul Islam Quadery ...
GeoPandas在地理空间数据分析中的应用
eeee~~的博客
09-13 970
本文演示了基于GeoPandas库在世界地图中根据经纬度进行地点标记。
数据分析-25-时间序列预测之基于keras的LSTM+注意力机制预测风速
qq_20466211的博客
09-13 238
将LSTM与注意力机制结合时，通常的做法是在LSTM的输出上引入注意力权重，以便模型可以根据不同时间步的重要性来聚焦不同部分的输入序列。这有助于模型更有效地学习序列数据的长期依赖关系。
数据分析-13-时间序列异常值检测的类型及常见的检测方法
qq_20466211的博客
09-06 776
点异常、上下文异常、集合异常三种分类
数据分析-26-时间序列预测之基于ARIMA的时间序列数据分析
最新发布
qq_20466211的博客
09-13 104
使用ARIMA模型对国际航空乘客数据进行了建模和预测。结果表明，ARIMA模型在一定程度上能够准确预测未来的乘客数量，尤其是在季节性趋势较为明显的情况下。
基于深度学习的基因组数据分析
weixin_42605076的博客
09-10 926
基于深度学习的基因组数据分析为理解复杂的遗传信息和开发新的生物医学应用提供了强大的工具。随着技术的进步和数据积累，深度学习将在基因组学领域继续发挥关键作用，推动个性化医疗和精准医学的发展。
为数据仓库构建Zero-ETL无缝集成数据分析方案（下篇）
m0_66628975的博客
09-10 1689
服务之间直接集成，不需要使用额外组件完成数据 ETL 的工作。把各种各样的数据都连接到执行分析所需要的地方，实现数据平滑“无感”的流动。它可以帮助用户最大限度地减少甚至消除构建 ETL 数据管道的复杂性。提高敏捷性。简化了数据架构并减少了数据工程的工作量。它允许增加新的数据源，而无需重新处理大量数据。这种灵活性增强了敏捷性，支持数据驱动的决策和快速创新。成本效益。利用云原生且可扩展的数据集成技术，使企业能够根据实际使用情况和数据处理需求来优化成本。组织可以减少基础设施成本、开发工作和维护费用。
mirna靶基因预测
07-27
对于mirna靶基因预测，通常采用生物信息学方法来预测。这些方法基于miRNA与mRNA的互补配对原理，通过分析miRNA序列与mRNA序列之间的相互作用，预测miRNA可能的靶基因。 常用的mirna靶基因预测方法包括以下几种： 1...
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