文献解读|miRNA与多组学联合分析阐明花生花青素合成新机制

最新推荐文章于 2024-10-27 22:51:17 发布

作图帮

最新推荐文章于 2024-10-27 22:51:17 发布

阅读量851

点赞数

文章标签：人工智能数据挖掘机器学习

本文链接：https://blog.csdn.net/weifanbio/article/details/124835883

版权

该研究通过多组学和miRNA靶基因交互分析，揭示了花生花青素生物合成的新机制。在花生品种G110和Z18-40中，Z18-40的花青素含量显著高于G110。研究鉴定了14个相关候选基因，特别是与HCT生物合成相关的Ah21440基因。通过联合多组学分析，发现花青素3-O-葡萄糖苷是唯一共同的差异累积代谢物。miRNA AhmiR2950、AhmiR398、AhmiR50和AhmiR51调控花青素合成相关基因，为花生种皮花青素代谢机制的研究提供了新视角。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

TITLE：Multi-Omics and miRNA Interaction Joint Analysis Highlight New Insights Into Anthocyanin Biosynthesis in Peanuts（Arachis hypogaea L.）
译名：miRNA与多组学联合分析阐明花生花青素合成新机制
期刊：Frontiers in Plant Science
日期：2022年2月
下载链接：
https：//doi.org/10.3389/fpls.2022.818345
在这里插入图片描述

研究介绍

本研究选取具有粉色和紫色种皮的两个花生品种G110（G）和Z18-40（Z）进行多组学和miRNA靶基因互作联合分析。通过紫外-可见分光光度计（UV-5800，中国上海）测定，在开花后30天和45天，Z18-40的花青素含量比G110高7.49- 8.62倍。然后，在不同的比较组中共鉴定出14个与花青素生物合成相关的候选基因（R2≥0.80），其中有一个与HCT（羟基肉桂酰转移酶）生物合成相关的新基因Ah21440。此外，通过联合多组学分析，在G1_vs_G2、Z1_vs_Z2、G1_vs_Z1和G2_vs_Z2中仅鉴定出花青素3-O-葡萄糖苷（Kuromanin， pmb0550）为唯一的共同差异累积代谢物（DAM）。miRNA与转录组中DEGs的相关性分析显示，AhmiR2950、AhmiR398、AhmiR50和AhmiR51调控HCT和查尔酮生物合成相关候选基因（Ah21440、AhCHS、AhCHI）。最后，对14个候选基因和4个差异表达miRNA进行了定量实时荧光定量PCR（qRT -PCR）验证，其趋势与之前的转录组数据一致。研究结果为深入研究花生种皮花青素代谢机制提供了重要参考。

研究目的

花青素是植物的次生代谢产物，存在于27个开花植物科的72个属中，具有生理健康作用如抗衰老、抗突变、预防心血管疾病、保肝抗癌等，随着人们越来越关注健康问题，花青素生物合成因此成为研究人员高度研究的化合物。

本研究采用转录组-代谢组联合分析方法对双亲种皮进行花青素合成的差异表达基因（DEGs）研究，并分析miRNA靶基因的相互作用。结果有望为浓缩花青素花生品种的栽培提供有益的见解。有望为花生种皮花青素代谢机制的深入研究提供参考。

材料与方法

材料：
在这里插入图片描述
本研究选用高油酸（O：79.52%； L&#x