避免再次出现下载SRA数据找不到下载链接,记录一下
1,下载sra工具,去官网上下载sratoolkit最新版本https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=software,解压安装。
2.然后在NCBI里面搜索SRA,输入所查找的号,比如SRR6040618
3.进入后,点击右上角的Send to,选择File,在下拉页选择Runinfo,点击Create file。这时会下载srarunindo.csv,然后download_path栏就是下载地址。
4.复制地址,用wget下载即可。
5.或者是下载ftp文件
NCBI存放路径:
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR548/SRR5483090/
可见ftp构成: