ncbi下载sra数据

避免再次出现下载SRA数据找不到下载链接,记录一下

1,下载sra工具,去官网上下载sratoolkit最新版本https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=software,解压安装。

2.然后在NCBI里面搜索SRA,输入所查找的号,比如SRR6040618

3.进入后,点击右上角的Send to,选择File,在下拉页选择Runinfo,点击Create file。这时会下载srarunindo.csv,然后download_path栏就是下载地址。

4.复制地址,用wget下载即可。

5.或者是下载ftp文件

NCBI存放路径:

ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR548/SRR5483090/
可见ftp构成:

  • 1
    点赞
  • 15
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 2
    评论
评论 2
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值