Seurat数据指控中有cell cycle scoring,并在标准化环节可以去除这种影响。不过我一般不这么做,而且seurat cell cycle本质上是基于打分,结果辩证看待。
tricycle原理是向预先注释好的数据集投射,结果在跨平台、物种、器官中都有很好的迁移性。使用起来非常轻量,本质上就两句命令。
tricycle: Transferable Representation and Inference of Cell Cycle
Seurat数据指控中有cell cycle scoring,并在标准化环节可以去除这种影响。不过我一般不这么做,而且seurat cell cycle本质上是基于打分,结果辩证看待。
tricycle原理是向预先注释好的数据集投射,结果在跨平台、物种、器官中都有很好的迁移性。使用起来非常轻量,本质上就两句命令。
tricycle: Transferable Representation and Inference of Cell Cycle