肿瘤研究新热点——非因空间多组学技术在肿瘤微生物空间分析中的研究策略

越来越多的证据证明，瘤内微生物群(Intratumoral Microbiota)广泛存在于不同类型的肿瘤中。同时，肿瘤内微生物群的组分、空间分布以及与肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)中宿主细胞的相互作用，在肿瘤的发生发展中起着复杂的相互调控作用。随着原位空间组学技术的快速发展，关于瘤内微生物群的研究也上升到了一个全新的层面[1-3]，尤其是在TME中菌群的空间分布及其对宿主细胞异质性的影响已然成为当下研究的热点之一。

但由于肿瘤内微生物载量相对较低且肿瘤内微生物的空间分布和局部作用信息易丢失等问题，使得研究者对肿瘤微环境中微生物群和宿主细胞同时进行原位检测和分子特征描述成为重大挑战。

免疫荧光技术在微生物成像中发挥着重要作用，其灵敏度可以实现原位捕获低检测阈值的微生物分布与表达。而作为目前主流的空间组学分析技术，Digital Spatial Profiler (DSP)数字空间多组学分析技术可实现肿瘤微环境中特定细胞多达上百种蛋白和上万种RNA定量，实现空间转录组和空间蛋白组的联合分析；同时，DSP数字空间多组学技术可以将传统的免疫荧光技术与数字可视化编码技术相结合，从而实现肿瘤微环境中微生物群和宿主细胞共定位，并对宿主细胞或菌群进行分子表达特征研究。在此，我们总结了DSP数字空间多组学分析技术在肿瘤微生物空间分析中的研究策略，为广大科研工作者提供参考依据。

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研究策略

研究策略一：

利用免疫荧光