在pharmit里匹配药效团

我把400个无活性的小分子（decoys）提交到pharmit里。

命名为decoyset00~decoyset08，查找时，按这个找。

1、导入药效团配体：

进入药效团筛选界面：

导入代表药效团模型的活性肽构象：

 2、选择预先设置好的药效团特征空间排列：

打开mescollection.xlsx文件，根据每个frame里记录的药效团特征信息，恢复pharmit网站里的药效团模型：

3、对诱导剂分子数据集进行匹配：

点击Search CHEMBL32按钮，在Contributed Libraries里搜索对应的诱导剂数据集，例如这里是decoyset00：

 

点击Search decoyset00，等待右侧的匹配结果 出现：

在第1页表格里26aa构象里匹配到4个，7aa匹配到1个构象。 

4、记录匹配到的结果：

可以先将第1页表格的数据记录到excel里：

 

 逐页更新表格的内容，例如第2页表格里26aa又出现3个构象成功匹配模型，就将原先4加上3变成7：

将每页表格中出现的构象逐一增加到xlsx表格里，最后对没有匹配到的构象赋值0，完成这一帧模型和这50个诱导剂化合物数据集的药效团检索：

 5、保存当前的记录（存档）：

点击Save Session记录当前的状态为一个json文件：

 打开一个空白的pharmit操作页面，点击Load Session导入之前保存的json文件，就会回到存档位置：

结果如下图，需点击Search decoyset00，重新开始匹配：