生信技能21 - 读取生信分析样本多个文本文件结果，合并为一个dataframe

生信与基因组学

已于 2023-04-18 21:28:32 修改

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分类专栏：生信分析项目实战技能合集文章标签： python 数据分析数据挖掘

于 2023-04-18 21:27:59 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/LittleComputerRobot/article/details/130231201

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本文档展示了在生信分析项目中如何使用Python读取多个样本的TSV文件内容，并将这些内容合并成一个DataFrame，进一步解释了这一过程并提供了保存合并后DataFrame的方法。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

合并dataframe在生信分析项目开发中经常会用到，以下代码以合并多个样本的的两种.tsv文件结果为例，演示如何进行tsv文件内容的读取，并且合并为一个Dataframe，然后保存。

import glob
import os
import optparse
import pandas as pd
from addict import Dict

def merge_all_sample_data(chip_run, bin_dir, tmp_dir

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