利用MTviz绘制线粒体基因组结构图

MTviz是一款在线工具,专门用于绘制线粒体基因组结构图。它支持从Genbank文件导入数据,允许用户调整基因名称大小、选择绘图选项,并导出为多种矢量图格式。操作包括上传genbank或.xml文件,修改基因及图纸属性,以及自定义颜色和标注。此外,还介绍了如何从Geneious导出符合要求的文件格式。
摘要由CSDN通过智能技术生成

  MTviz是专门绘制线粒体基因组结构图的在线绘图软件,官方网址如下:http://pacosy.informatik.uni-leipzig.de/mtviz/。

1 软件功能

  1. 绘制成环的线粒体基因组结构图;
  2. 基因名称根据其可用的空间自动调整大小,保证比例的协调;
  3. 从Genbank格式的文件中读取并修改数据;
  4. 导出为eps、ps、pdf、png、jpg等矢量图格式,后续可以利用Ai软件进行修改;
  5. 可以对线粒体基因组的细节进行微调;
  6. 可以选择合适的字体、字体颜色以及背景颜色等。

2 操作步骤

  1. 上传genbank格式的文件;
  2. 改变特征的属性;
  3. 调整图纸的属性;
  4. 下载在右侧显示的文件或图片。

下载网站示例中的genbank文件,通过Geneious这款软件打开,显示效果如下图,将自己的线粒体基因组按照该文件样式进行修改,修改好了再导出为genbank格式即可。
官网虽然要求输入genbank格式的文件,但并不能直接上传后缀名为.gb的文件,可以将利用Geneious修改好的线粒体基因组导出为.xml格式再来上传。

在这里插入图片描述

图1 卷蛾赤眼蜂的线粒体基因组结构图

3 绘图界面

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