MTviz是专门绘制线粒体基因组结构图的在线绘图软件,官方网址如下:http://pacosy.informatik.uni-leipzig.de/mtviz/。
1 软件功能
- 绘制成环的线粒体基因组结构图;
- 基因名称根据其可用的空间自动调整大小,保证比例的协调;
- 从Genbank格式的文件中读取并修改数据;
- 导出为eps、ps、pdf、png、jpg等矢量图格式,后续可以利用Ai软件进行修改;
- 可以对线粒体基因组的细节进行微调;
- 可以选择合适的字体、字体颜色以及背景颜色等。
2 操作步骤
- 上传genbank格式的文件;
- 改变特征的属性;
- 调整图纸的属性;
- 下载在右侧显示的文件或图片。
下载网站示例中的genbank文件,通过Geneious这款软件打开,显示效果如下图,将自己的线粒体基因组按照该文件样式进行修改,修改好了再导出为genbank格式即可。
官网虽然要求输入genbank格式的文件,但并不能直接上传后缀名为.gb的文件,可以将利用Geneious修改好的线粒体基因组导出为.xml格式再来上传。