数据库 | ViroidDB：类病毒及类病毒样环状RNA数据库

类病毒，又称感染性RNA、病原RNA、壳病毒，是已知最小的传染因子。对类病毒的研究可能为揭示生命起源和进化、生命过程的实现等生命科学的重大理论问题作出贡献，随着高通量测序的发展，越来越多的学者开始关注类病毒的研究。ViroidDB是目前已知最完整的数据库，为类病毒RNA的分析和分类提供一致的、可用的和最新的开放资源。该数据库可访问地址：https://viroids.org。

ViroidDB包含了目前已知的类病毒和类病毒环状RNA序列，涵盖约10 000个独特序列，包括类病毒、类逆转录病毒元件、小型环状卫星RNA、核糖病毒和逆转录酶等。

利用ViroidDB数据库，可以预测每个序列的二级结构、核酸酶含量和簇成员，并可以通过序列类型、分类单元或原始数据搜索来浏览数据。

在ViroidDB数据库中，用户可以通过模糊搜索、高度匹配搜索和种子搜索，得到序列的基本信息、样本收集信息以及FASTA格式的核苷酸序列和资源链接。切换核苷酸序列，可以获得反向互补序列、二级结构、以及DNA和RNA碱基之间的转换，还可以直接复制或下载FASTA格式的核苷酸序列。

Tips

凌恩-盈飞团队，致力于开拓前沿分子生物学技术和高性能计算在生命科学研究、分子育种及人类健康领域的应用，旨在为生命科学领域用户提供国际领先的数据管理和分析解决方案。公司拥有多项自主专利技术和软件著作权，帮助客户成功开发多种分析软件、生信分析云平台、及包括数十个动植物物种数据库在内的多功能整合型数据库及管理应用平台，为科研及医学用户提供安全便捷的数据管理和应用解决方案。客户群体涵盖高等院校、科研院所、三甲医院及疾控中心，药企及基因检测公司等。

参考文献

ViroidDB: a database of viroids and viroid-like circular RNAs. Nucleic Acids Research, 2021.