Microbiome|肠-肝轴：宏基因组+脂质组+靶向代谢

SHANGHAILINGEN

于 2024-08-23 11:19:23 发布

阅读量870

点赞数 11

文章标签：测序组学

本文链接：https://blog.csdn.net/SHANGHAILINGEN/article/details/141461046

版权

蚕桑业最大的副产品桑枝纤维（MF）的利用是一个重要问题。在家禽饲养中添加 MF 作为膳食纤维可能发挥其作用。然而，人们对MF对蛋鸡肝脏脂质代谢和蛋黄脂肪酸组成的影响及其潜在机制知之甚少。

近日，凌恩生物客户——云南省农业大学动物科学技术学院潘洪彬教授团队在微生物领域权威期刊《Microbiome》发表题为“Mulberry branch fiber improved lipid metabolism and egg yolk fatty acid composition of laying hens via the enterohepatic axis”的研究论文。研究利用多组学探索蛋鸡肝脏脂质代谢、蛋黄脂肪酸组成、肠道微生物群的变化、日粮MF引起的变化以及它们之间的关联。

实验设计及测序方案

360只母鸡随机分为5组，饲养49天后，每个重复采集2个鸡蛋测定鸡蛋品质以及蛋黄脂肪酸组成。每个重复取1只母鸡采集肝脏和盲肠进行分析。

肠道：宏基因组测序分析肠道细菌和病毒多样性靶向代谢分析肠道短链脂肪酸和氨基酸代谢

肝脏：脂质组

图1 实验设计

主要结果

1 鸡蛋的品质

首先我们来看一下鸡蛋的品质有没有变化？从蛋重、蛋形、蛋壳厚度、蛋壳强度、蛋白含量、哈氏单位、蛋黄重、蛋黄比、蛋黄颜色等维度评估，发现添加MF对蛋壳厚度有显著的线性影响（表2)。

表2 饲粮中添加MF对鸡蛋品质的影响

2 肝脏的脂质组分析结果

饲粮中添加5%的MF显著降低了蛋鸡的肝脏脂肪含量，也减少了与脂肪酸合成相关的酶活，由此可见，饲粮中添加MF可降低蛋鸡肝脏脂肪蓄积，有效降低脂肪肝的发生。

图2 添加MF对肝脏脂肪指数和代谢相关酶活性的影响

3 蛋黄的脂肪酸含量

与CK组相比，蛋黄总饱和脂肪酸（SFA）和总不饱和脂肪酸(USFA)分别显著降低和增加在MF5组。蛋黄中脂肪酸的组成在MF5和CK样品之间有显著的差异。这些发现证明了MF促进蛋黄中PUFA的含量进而影响鸡蛋的品质。

图3 CK组和MF5组蛋黄脂肪酸含量的差异分析

4 肠道菌群的变化

宏基因组分析结果表明，与MF组的蛋鸡相比，添加MF的蛋鸡肠道细菌和病毒群落的Chao1指数均显著降低，β多样性分析显示肠道细菌和病毒群落发生了显著变化，添加MF的蛋鸡的肠道细菌和病毒群落的组间变异增加。总之，粮中添加MF对蛋鸡肠道菌群多样性和组成有明显影响。

基于KEGG注释发现盲肠中多个代谢通路的丰度受到饲粮中MF的显著影响。膳食MF在改善主要食物代谢的同时，降低了AA代谢和o -糖的生物合成能力。网络分析探讨了肠道微生物组成与这些不同功能通路之间的潜在关系，表明与肠道病毒相比，肠道微生物功能与细菌的联系更紧密。

图4 添加MF后鸡肠道细菌和病毒群落多样性分析

图5 肠道菌群功能变化

5 肠道菌群的代谢变化

靶向代谢组测定了CK组和MF5组盲肠短链脂肪酸（SCFAs）和氨基酸（AAs）的组成，发现饲粮中添加MF可以促进肠道菌群对短链脂肪酸的合成，影响尿素循环。在宏基因组数据集中筛选尿素循环的关键基因，确认了膳食MF对短链脂肪酸生物合成的影响可能主要与更丰富的ACSS1_2基因有关。

图6 肠道菌群的代谢差异

6 多组学联合分析，探究MF对蛋鸡调节的机制

对肠道菌群、脂代谢和蛋黄脂肪酸组成进行相关性分析。肠道菌群与肝脏脂肪含量存在相关性，肝脏脂代谢相关酶活性与与肠道菌群多样性呈负相关，与肠道细菌和病毒呈多重相关，蛋黄中PUFA和MUFA含量与肠道菌群之间存在相关性。总之，饲粮中添加MF通过直接影响肝脏酶活性和间接影响肠道细菌多样性来改善蛋品质。

图7 多组学联合分析

总结

本研究利用宏基组学、脂质组学、靶向代谢组学等多组学联合分析，解析饲粮中桑枝纤维对蛋鸡肝脏脂质代谢、蛋黄脂肪酸组成、肠道微生物群的影响。该研究揭示了桑枝纤维可通过“肠-肝”轴降低蛋鸡肝脏脂肪沉积，并提高蛋黄脂肪酸组成，从而改善蛋鸡的蛋品质。该研究为桑枝纤维应用在蛋鸡生产上了提供理论支持。