基因沉默(gene silencing)是生物体中重要的分子生物学过程,一般由siRNA(small interference RNA)和miRNA(micro RNA)介导。而两种RNA由于其复杂的作用机制和高效的沉默效率,在过去20年来都是分子生物学研究的热点。由于两者的作用机制比较类似,所以在概念上极易混淆。
1 miRNA
miRNA来源于特定的长链ssRNA(single-strand RNA),通过其自身的互补配对形成环茎结构,经过一系列切割、降解后形成成熟的miRNA,实现基因功能沉默。
2 siRNA
siRNA来源于同源的ddRNA(doubled-strand RNA),可分为内源siRNA和外源siRNA。外源siRNA可由病毒RNA感染(例如:VIGS)、转基因(例如:RNAi)等原因导致,而内源的siRNA可有两种形成方式,分别被命名为nat-siRNA(natural-antisence transcript derived siRNA)和ra-siRNA(repeat-associated siRNA)。
除了按形成方式划分外,从作用机制上还存在phased-siRNA(相位siRNA),其依赖于特异性miRNA的剪切,即可顺式作用于其来源基因,称为cis-siRNA(ca-siRNA),又可反式作用于其来源基因的同源基因,称为trans-siRNA(ta-siRNA)。
PS:此图片来自(DOI:10.13376/j.cbls/2018098)