孟德尔随机化——如何选择工具变量

背景知识，推荐阅读：
Guidelines for performing Mendelian randomization investigations
讲了为什么要做MR、MR的原理、工具变量的选择、MR方法、

首先工具变量需要满足三个核心条件

Ref：Appraising the Causal Association of Plasma Homocysteine Levels With Atrial Fibrillation Risk: A Two-Sample Mendelian Randomization Study

其中B就是horiziontal pleiotroypy，一般就是文章提到的pleiotropy多效性；即这个SNP不只和暴露相关，还和混杂相关（通往结局的通路不同）；这样的SNP就是需要排除的。
还有一种就是vertiacal pleiotropy，又称indirect或mediated，就是指这个SNP和一些同样在这条通路上的其他变量相关；暴露和这些变量通往结局的通路相同，起到了中介的作用（下图a-c）。