LAMMPS命令学习

一、boundary命令

语法：boundary x y z

（1）周期性边界：p

参数p表示周期性边界条件，当粒子从一侧飞出，会从相对应的另一侧再次进入box，一般情况下不会发生“lost atoms”丢失原子错误。

（2）固定边界：f

参数f表示box的表面在该方向上被固定住，不因体系压力的变化发生移动，如果原子从一个表面飞出，会提示“lost atoms”错误，设置thermo_modify lost可以允许原子丢失，否则模拟过程会被终止。

（3）收缩性边界：s

参数s表示在该方向上，盒子的表面会根据体系的压力大小或原子运动情况发生移动。

一般情况下，盒子会配合原子的移动，尽量把原子包含在box内，但是当原子速度过快，位移太大时原子也可能会飞出盒子，造成“lost atoms”错误。

（4）限制性收缩：m

参数m功能和s差不多，盒子大小同样会随原子的移动而发生变化，但盒子在收缩到限定值时就不再发生变化，也就是盒子尺寸有一个最小值