boundary命令设置box的边界条件,语法比较简单:
boundary x y z
参数xyz分别设置该维度的边界条件,最基本的边界条件有四种:p、f、s、m。
lammps支持对同一方向的两个边界设置不同的边界条件,对y方向下表面设置f边界、上表面设置s边界,可以写为:
boundary p fs p
1.周期性边界:p
参数p表示周期性边界条件,当粒子从一侧飞出,会从相对应的另一侧再次进入box,一般情况下不会发生“lost atoms”丢失原子错误。
2.固定边界:f
参数f表示box的表面在该方向上被固定住,不因体系压力的变化发生移动,如果原子从一个表面飞出,会提示“lost atoms”错误,设置thermo_modify lost可以允许原子丢失,否则模拟过程会被终止。
3.收缩性边界:s
参数s表示在该方向上,盒子的表面会根据体系的压力大小或原子运动情况发生移动。
一般情况下,盒子会配合原子的移动,尽量把原子包含在b