教程 | 做一个自己专属的本地 BLAST 数据库

写在前面

中秋和国庆期间，我总是要往返广州贵阳。工作在广州，家人在贵阳，于是多出了不少旅途时光。手机信号自然是没有，也常常是夜晚的航班。播客听多了，发现只能等着节目更新。来来去去，最后还是要闭眼思考。

1. 活着，为了什么？

2. 这个课题怎么做？那个课题怎么做？

3. 有没有什么新课题想法？

4. 是不是把一些想法给忘掉了

当然，常常有成果的，自然还是“TBtools的优化”。可能，这是比较简单的事情。
开发至今 6 年有余，最早期的功能包括 Fasta 序列提取 和 Blast 界面化。事实上，这些功能从当初开发到现在，几乎没有更新过。或许只能说，我写得挺好，功能挺稳健。不过，必须承认，有时候用起来还是不太方便，尤其是切换不同数据库比对，类似的工作不时重复。已有的界面如下：

其他 Blast 界面化功能是类似的。我们完全可以想象得到，不够方便，尤其是当我们在本地做足够多的分析时。
于是，我们需要“革自己的命”，实现一些新的功能，从更高维度降低数据分析的繁杂程度。

Blast Zone 简介

经过简单的思索，在带娃的闲暇之余，我写了一个自认为还不错的新插件，命名为“Blast Zone”。查看这个功能，首先是更新 TBtools 到版本 v1.09866 或者更高版本（为了匹配这个功能更新，我跳过了 6 个版本号）。随后可以在熟悉的地方找到这个功能。

点击即可查看

一般来说，尤其是对于 Windows 用户（当然 Mac 也相同），建议首先点击Config摁钮，调整默认数据库放置的位置，以方便后续分析。

BLAST 数据库的添加与删除

添加数据库

开始建立一些数据库

数据库建立完成可见

类似的可以增加系列数据库

删除数据库

相比于添加数据库，删除数据库更为简单。只要选择指定数据库，点击 “-” 按钮即可。

可以看到

进行 BLAST 序列比对

“Blast Zone” 上开展 BLAST 分析，相比于 TBtools 中已有功能会更为方便。

查看结果

当然，也可以直接“Text View”。

切换一个数据库比对，只需要鼠标点击选择另外一个数据库即可

其他特性

当然，最重要的是，Blast Zone 的数据库可以随时“重用”。关闭 TBtools，重新开启，那么数据库列表跟前一次关闭时，保持一致。

更有趣的地方，以后再说…

写在最后

路漫漫，其修远兮~
一步一个脚印，做好自己即是一切。