生物信息分析技术在胃肠道疾病研究中的应用
胃肠道疾病简介
胃肠道是人体最大的免疫器官,也是人体最大的排毒器官。胃肠道指的是从胃幽门至肛门的消化管常见的胃肠道疾病有:胃炎,克罗恩病,溃疡性结肠炎,阑尾炎,肠易激综合征等。现如今,胃肠道疾病发病率高,其病程较长、治疗较难、反复发作等均是胃肠道疾病的特点。由于胃肠道疾病复杂的发病机制,为其生物学研究的遗传机制带来重重困难。此外,在人的肠道中栖息着大量微生物, 在消化吸收、能量代谢、免疫调节、抗病能力等方面发挥着重要作用, 与很多疾病的发生发展相关。 通过生物学手段研究肠道菌群对临床治疗具有非常重要的意义。
生物信息学在胃肠道疾病研究中的应用
随着测序技术的发展以及后基因组时代的到来,通过对DNA(基因组)、mRNA(转录组)、微生物(宏基因组)和蛋白序列(蛋白质组)的分析,分子生物学家能够更加精细地研究胃肠道相关疾病。如对蛋白质组学数据进行分析,为研究蛋白质水平的生命活动提供了新的有效研究手段。通过对不同组织或者样本的蛋白质表达进行差异分析,可以反映出生物体在不同时刻和状态下蛋白质表达的变化情况。分析比较不同条件下蛋白质组的变化和差异,发现和鉴定在不同生理条件下蛋白质组中的差异组分,从中揭示一定的生物学现象和疾病发生规律。此外,如对胃肠道菌群基因芯片、宏基因组测序数据进行分析,对胃肠道菌群方面的研究提供数据基础,为临床研究提供参考。生物信息学不断应用于各种胃肠道疾病的研究中,对阐明胃肠道疾病发病机制以及诊断和治疗起着巨大的推动作用。