蛋白质残基相互作用网络分析

简介

蛋白质由20种不同的氨基酸经肽键聚合组成，通过形成特定的空间三级结构以实现催化和调控不同的生物学功能，不同的氨基酸排列顺序会形成不同的蛋白质结构，蛋白质三维空间结构决定了其生物学功能。因此，蛋白质三维结构研究对理解其如何发挥生物学功能和设计相关的药物具有重要意义。其中，蛋白质残基相互作用网络分析普遍应用于蛋白质相关问题的研究。该方法中网络的节点为组成蛋白质的残基，网络的边为非共价键残基相互作用，如范德瓦尔斯和静电相互作用等。基于蛋白质残基相互作用网络，可以进一步利用图论的方法研究蛋白质结构稳定性，蛋白质动力学，酶活性和变构调节，信号转导等问题。蛋白质残基相互作用网络对理解蛋白质的结构特征，生物学功能和结合位点预测等研究有重要的作用。对生物医学领域的疾病研究和药物设计相关应用研究有较大的帮助。

应用领域

蛋白质结构研究：蛋白质结构稳定性，蛋白质动力学，酶活性和变构调节，信号转导。
蛋白质生物学功能研究：蛋白质生物学功能及结合位点预测，疾病的发生发展机制研究，以及药物设计分析。

蛋白质残基相互作用网络分析流程