如何做蛋白质互作网络图

已于 2022-04-27 10:20:31 修改
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于 2022-04-26 10:50:59 首次发布
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本文介绍了如何利用String数据库（Version 11.5）进行蛋白质互作网络图的绘制。通过查询特定蛋白质或多个蛋白质的交互信息，可以获取到包含直接物理作用和间接功能相关性的相互作用数据。在分析过程中，可以调整设置，如选择显示的相互作用类型和过滤低可信度的互作关系。最终，用户可以导出所需的互作网络结果。
摘要由CSDN通过智能技术生成

 使用String数据库，可以做做蛋白质互作网络图。String数据库（https://string-db.org/）是目前数据量最丰富、应用最广泛的研究蛋白质相互作用的数据库之一。目前，String数据库已更新到Version 11.5版本。收录了超过14000个物种、6千多万种蛋白、200多亿个相互作用的信息。这些蛋白质相互作用既包括直接的物理作用，也包括间接的功能相关性。

String数据库使用方法

1、查询特定蛋白的互作信息

A、打开STRING数据库（https://string-db.org）

B、点击“Search”。选择“Protein by name”，输入目标蛋白或者基因名称

C、在“Organism”中选择指定物种

D、点击“SEARCH”进入分析。

以AGO2蛋白为例，下图展示了AGO2的主要的相关蛋白。

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STRING网站分析蛋白质相互作用
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RNA-seq分析：Step10（Cytoscape制作蛋白质互作网络及寻找核心基因）
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03-22 7238
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STRINGdb包进行蛋白质相互作用网络分析
qq_27390023的博客
01-13 2594
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