本文介绍如何用Annovar注释人类以外的基因组。
分析过NGS
数据的朋友应该都听说过乃至使用过Annovar
这个工具。
Annovar是一款对基因组数据进行注释
的软件。所谓注释,可以这样简单理解:我们知道二代测序下机后的序列经过比对后,会得到一系列变异数据,这些变异数据只是告诉我们在基因组的某个位置发生了一段序列的改变,至于这个改变会不会影响生物学功能,我们并不清楚。而注释就是将基因组的序列变异数据转化为我们更关心的生物学功能变化的信息。
Annovar常被用在人类基因组的注释上,其实,它也可以对人类以外的基因组数据进行注释。比如,老鼠基因组的注释上。点击[阅读原文](https://www.cnblogs.com/Raymontian/p/7113096.html)
可以查看具体方法。