已知uniport ID 下载 seq

最新推荐文章于 2024-06-01 10:35:00 发布

李划水员

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分类专栏：蛋白质基础文章标签： python

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task如题，可以改成批处理的代码哦

from API demo
import requests

def download_sequence(protein_id):
    url = f"https://www.uniprot.org/uniprot/{protein_id}.fasta"
    response = requests.get(url)
    if response.status_code == 200:
        return response.text.split('\n', 1)[1]  # 分割字符串，并只返回第一个换行符之后的部分（即序列部分）
    else:
        print(f"Error: {response.status_code}")

if __name__ == "__main__":
    protein_id = "P0DTD1"  # UniProt 蛋白质 ID
    sequence = download_sequence(protein_id)
    print(sequence)