薛定谔分子对接教程
chrodinger是药物发现的完整软件包,包括:基于受体和配体结构的诱导契合和柔性对接模式;基于受体结构及配体极性的对接模式;基于受体结构及溶液环境性质的对接模式;组合化学库设计及基于组合库的对接模式;基于配体结构的药物设计,药效团和3D-QSAR;生物分子结构模拟,蛋白、糖、核酸、小肽等;基于靶点的药物设计;ADME性质预测;
参考:
Maestro 薛定谔软件使用:
- https://www.bilibili.com/video/BV1RN411X7Te
- https://www.youtube.com/watch?v=NkM8jjHr7f4&list=PL3dxdlKx_PcfuvHwJ0RjpZFt4HjwyTr7f
Maestro 薛定谔对接:
- https://www.bilibili.com/video/BV17p4y1h7mG
- https://space.bilibili.com/1119860191/channel/seriesdetail?sid=287811
额外注意:生成grid时候,如果有配体存在,按照氨基酸生成方式生成,记得删除掉配体,不然对接的时候会把配体当成蛋白一体的;如果按照氨基酸生成方式生成,没有配体,或者直接按照配