lammps技巧:原子位于box外面导致模拟出错的解决办法

大家好,我是小马老师。
在lammps模拟中,原子必须位于模拟盒子box的内部,当因为建模方式不当造成原子处于box外面时,lammps会给出错误提示,造成模拟中断。
例如,下图中的Cu纳米线,使用Atomsk建模方式,因多次旋转导致最上部的原子处于盒子的外面:
在这里插入图片描述

在lammps模拟是会提示如下错误:
在这里插入图片描述

当出现这种错误时,一般就是有原子处于盒子外面。
解决这种问题的方法比较简单,用记事本打开data文件,修改box的Z坐标值即可。
在这里插入图片描述

修改之后的结构如图下图所示,所有原子已经在box里面:
在这里插入图片描述

这时候就能够顺利进行lammps模拟了。
当模拟出现错误时,最好的方法是看错误提示,根据错误提示分析原因,有的放矢地解决问题。
在模拟过程中出现问题不能解决时,可以微信联系我,也可以参加一对一的培训和咨询服务,由专业教师帮你解答lammps模拟过程中的问题。
根据课题方向不同详细讲解对应的in文件编写方法、模拟关键技术、数据后处理,经一对一咨询辅导后能够独立编写出in文件。

具体内容可查看公众号一对一培训说明:lammps 一对一培训与咨询指导

公众号案例代码以及学习交流,请加QQ群:754749935
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