在整个基因转录翻译的过程当中,基因是在细胞核发生转录,然后出核到细胞质当中发生翻译。对 lncRNA 而言,由于lncRNA的功能主要还是通过影响其它基因来实现的。所以 lncRNA 在不同的位置影响的功能肯定也是不一样的。如果在细胞核,就是参与转录调控了,经典的方式还是影响ceRNA的方式来进行调控;而如果在细胞质的话,那就参与转录后调控了,比如和mRNA形成互补双链来增加 mRNA 的稳定性。所以在研究 lncRNA 的时候,知道 lncRNA 的定位还是很有必要的。今天就给大家介绍几个预测lncRNA定位的数据库。
老基因查询
如果我研究的基因是其他人已经研究很深入的基因了,一般都会有人去做其细胞定位的。这个时候我们可以使用 RNALocate (地址见文末)进行查询。这个数据库通过文本挖掘的方式,来挖掘了已经有研究报道的基因定位。
这个数据库提供了检索的功能,我们只需要提供相关的基因名就可以来检索到结果了。
通过检索,我们就可以得到这个基因目前研究定位的具体结果了。如果有结果的话,数据库会把相关的句子列出来,来证明其文章挖掘的正确性。同时如果这个定位结果来自于数据库,也会把数据库的信息列出来。
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