数据库推荐，qPCR引物设计与评价

最新推荐文章于 2023-12-29 15:28:42 发布
最新推荐文章于 2023-12-29 15:28:42 发布
阅读量957 收藏 3
点赞数 1
原文链接：https://www.51xxziyuan.com/55/1307.html
版权
本文介绍了一款用于qPCR实验中引物设计的软件MPRrimerW2及评估引物质量的数据库MFEprimer。MPRrimerW2支持多个物种的引物设计，并允许批量输入基因进行一次性设计；MFEprimer则为评估引物质量提供支持。
摘要由CSDN通过智能技术生成

我们在做qPCR的时候首先需要的就是设计引物。设计引物的软件有很多的。而这次介绍的这两个

MRPrimerW2是一个用来设计引物的软件。

MFEprimer是一个可以用来评估引物质量的数据库。

数据库地址见文末

 

MPRrimerW2

MPRrimerW2支持九个物种的引物设计网站。我们可以通过输入基因名/fasta序列格式来设计引物的数据库。

另外这个网站可以一下子输入很多的基因，来一次性的设计很多基因的引物。

640.jpeg

 

同时网站对于引物的自定义还有更近一步的设置。这个方便我们设计出自己想要的引物

 

文章剩余内容<<<<<

 

 

 

qPCR引物设计经验教程
avareart的博客
04-27 5205
常规基因表达量qPCR检测，首要的是设计一对特异的检测引物，下边如期生物以人的“FAU1”基因为例给大家简要介绍一下如果使用NCBI这个网站设计qPCR 打开NCBI网站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/；界面如下 在NCBI搜索栏下拉框选择“Gene”；输入框输入对应的物种及基因信息，并点击“Search”键进行搜索如下所示 点击“search”后，跳转到如下界面；单击对应的基因项 点击基因名称后，跳转到如下界面；
引物设计软件primer_一文搞懂引物设计
weixin_39795845的博客
12-04 5247
引物设计原则作为一个科研狗，日常实验中经常会遇到引物设计，毫无疑问，一对好的引物对实验结果很重要。在设计引物前，我们首先了解一下引物设计的原则，总结为以下7点：1. 要设计引物首先要找到DNA 序列的保守区。同时应预测将要扩增的片段单链是否形成二级结构。如这个区域单链能形成二级结构，就要避开它。2. 引物长度一般在15～30碱基之间，因为过长会导致其延伸温度大于 74℃，不适于 TaqD...
qPCR检测基因表达的引物数据库
diedie4488的博客
09-27 1250
老板推荐了一个专门用来做基因表达定量（qPCR）的引物数据库，还蛮好用的，都是别人实验验证过的，感觉比自己设计的更靠谱一下，附上链接：https://pga.mgh.harvard.edu/primerbank/ 转载于:https://www.cnblogs.com/Demo1589/p/7603801.html...
如何设计qPCR引物序列
weixin_47745419的博客
11-17 1万+
qPCR引物序列设计
primer5.0 引物分析软件
01-04
分子克隆软件超级好用 生物狗必备~~
生物信息学常用软件—2（PCR引物设计及相关软件使用）
xcaryyz的博客
02-05 7171
原文：http://blog.csdn.net/shmilyringpull/article/details/7342277 lPCR引物设计及相关软件使用 主要内容 1、背景 2、PCR引物设计原则 3、常用PCR引物设计软件 4、Primer Premier 5.0 介绍 5、Oligo 6.44介绍 6、在线Primer3 介绍
qPCR引物设计的骚操作，你get到了吗？
最新发布
qihengxing123的博客
12-29 671
6. 验证完之后就可以送公司进行合成啦，当然我们还需要做最后一步工作，就是引物的PCR验证，特别是产物特异性的验证，往往我们设计好的引物，在软件中的表现是完美的，但是在实际PCR的时候就会出现非特异性扩增的问题，这里面有可能是引物本身的原因，也有可能是试剂的原因，配置体系，盐离子浓度等等。而好的试剂是解决非特异性扩增的有利助手，启衡星Starligter SYBR qPCR Mix经过N轮的配方优化，帮您很好的解决了非特异性扩增的问题，为您简化引物设计及验证的流程，节省您的时间及成本！
引物设计&验证
tinygene的博客
04-14 1865
针对日益研究火热的微生物，微基生物新推出qPCR引物设计及验证，可以提供细菌菌株、菌种、菌属特异性qPCR检测引物设计及验证。 客户提供信息 对于菌株特异性qPCR引物设计服务，客户需提供该菌株拉丁文全名或该菌株的测序结果（建议提供全序列而非16S全长序列）。 对于菌属特异性qPCR引物设计服务，客户需提供属的拉丁文全名。 服务流程 1 通过查询菌株或菌属的序列信息，构建目的菌群全基因组数据库； 2 设计特异性引物 3 特异性引物合成、验证及优化 4菌株/菌属特异性qPCR大规...
3款简单实用的在线PCR引物设计软件
abdslfwoeugp
06-11 9996
1. NCBI 的 Primer-Blast； 2. Primer3 Plus； 3. PrimerBank
【实验技术笔记】RNA 抽提 + 反转录PCR + PCR引物设计 + RT-qPCR
热门推荐
abdslfwoeugp
06-15 2万+
分子生物学实验技术笔记 PCR引物设计 + RNA 抽提 + 反转录PCR + RT-qPCR
Real-time PCR 引物设计工具-Primer Express 3.0
05-01
如果你做real time PCR 的仪器是ABI 公司，设计引物时一定要用ABI 引物设计软件primer express，primer express 3.0当前最优秀的RT-PCR引物设计软件
oligo7 引物设计软件
11-22
设计PCR和RTPCR以及基因组引物，用于PCR扩增，检测或构建相关基因或质粒
Primer Express 3.0引物探针设计软件.rar
09-04
软件介绍: Primer Express是BI附着的一款用于设计引物和探针、荧光PCR探针的设计软件，能够精确计算寡核苷酸与荧光基团鳌合后的Tm值。可以预测引物与引物之间与模板之间等的二级结构。本版本为3.0版，在XP系统下能够正常使用，暂时没有最新的4.0版，如果WIN7下不能使用，请更改下程序的兼容模式，更改为XP兼容模式下试试能否运行。压缩包内附安装SN、PN及序列号。
MFEprimer-2.0：MFEprimer-2.0：一种基于热力学的快速程序，用于检查PCR引物特异性
02-16
MFEprimer-2.0 一种基于热力学的快速程序，用于检查PCR引物特异性 在线服务器 介绍 评估PCR引物的特异性是PCR引物设计中必不可少的步骤。 MFEprimer-2.0服务器允许用户快速轻松地检查针对基因组DNA和mRNA / cDNA序列数据库的引物特异性。 MFEprimer-2.0使用k-mer索引算法来加快引物结合位点的搜索过程，并使用热力学评估每个引物及其DNA模板之间的结合稳定性。 结果页面上报告了一些重要的特征，例如序列，融解温度和每个扩增子的大小，无论是特异性的还是非特异性的。 基于这些特征和用户友好的输出，用户可以轻松得出关于PCR引物特异性的结论。 MFEprimer-2.0还支持简并引物和多种PCR引物的分析。 此外，MFEprimer-2.0支持的数据库是全面的，还可以根据要求支持自定义数据库。 MFEprimer-2.0服务器不需要登录，可以从免费
引物设计流程
06-14
引物设计流程
使用linux批量引物设计,干货分享：如何快速设计多条qPCR引物？
weixin_42633137的博客
05-13 720
原标题：干货分享：如何快速设计多条qPCR引物？ 干货分享：小伙伴们，新的一周已经开始啦，有没有从周末中复苏过来，今天首先让我们来了解一款快速设计多条qPCR引物的数据库。MRPrimer使用篇qPCR成为诊断检测等多种技术手段的有利工具，在一个实验中，往往我们要设计多条qPCR引物，在多条引物的设计过程中，我们需要考虑引物之间的干扰等多种问题，目前已知的多种引物设计工具有尚有很多不足，比如需要耗...
引物设计软件primer_20款科研常用软件合辑（上）
weixin_39781186的博客
11-30 3695
子都曰了，工欲善其事，必先利其器。科研江湖凶险，不备几手常用兵器并日日习练，怎能与擅长套路的老油子们一争高下？科研这一行的兵器多如牛毛，岂能样样精通？解螺旋精选20款科研神兵器，馈送亲们，还贴心的附上使用攻略。今天先放出前10个阅读写作类和分子生物学方面的软件。阅读写作类1.Mendeley：文献大管家Win7以上 / Mac / Linux / IOS / AndroidMendel...
从零开始学PCR技术（三）：PCR引物设计
公众号/简说基因，知乎/简宝玉
11-30 8038
扩增子测序在临床基因检测中有广泛应用，合理的 Panel 设计非常重要，而 Panel 设计最终要落地，精心设计引物就是重中之重了。本文通过公开资料整理而成，志在让外行了解一些引物设计的...
linux设计引物探针,恳请相助：Taq man引物和探针设计
weixin_42515376的博客
05-16 387
实验要求为：用实时荧光定量PCR检测损伤前后大鼠某一基因的表达变化，选用Taq man法，从ncbi中查到基因cDNA序列如下：(基因编号：NM_053613)1 atgaagaggg cgtcctccgg aggaagccgg ctgccgacat gggtgttatg gctacaggcc61 tggagggtag caacgccctg ccctggtgcc tgtgtgtgct acaatg...
PrimerExpress：荧光定量PCR引物设计与操作指南
"荧光定量PCR引物设计软件说明书(PrimerExpress_guide).pdf" 荧光定量PCR（Quantitative Polymerase Chain Reaction, qPCR）是一种广泛应用于基因表达分析、病原体检测和遗传变异研究的技术。 PrimerExpress 是一款...
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值