qPCR引物设计经验教程

最新推荐文章于 2023-12-29 15:28:42 发布
最新推荐文章于 2023-12-29 15:28:42 发布
阅读量5.3k 收藏 25
点赞数 2
文章标签： 其他
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/avareart/article/details/124445009
版权
本文提供了一种使用NCBI网站设计qPCR引物的方法，以人类'FAU1'基因为例，详细介绍了从搜索基因、选择转录本到调整设计参数、获取引物序列的步骤，强调了PCR产品大小和GC含量对于引物设计的重要性。
摘要由CSDN通过智能技术生成

常规基因表达量qPCR检测，首要的是设计一对特异的检测引物，下边如期生物以人的“FAU1”基因为例给大家简要介绍一下如果使用NCBI这个网站设计qPCR

  1. 打开NCBI网站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/；界面如下

  2. 在NCBI搜索栏下拉框选择“Gene”；输入框输入对应的物种及基因信息，并点击“Search”键进行搜索如下所示

  3. 点击“search”后，跳转到如下界面；单击对应的基因项

  4. 点击基因名称后，跳转到如下界面；拉到底部转录本位置

  5. 如下图，选择需要检测的转录本；并单击

最低0.47元/天 解锁文章
miprimer：用于设计miRNA qPCR流程的DNA引物的Webapp
02-06
PCR引物设计算法DNA引物是根据本文的规则设计的用法* nix 关于虚拟环境 pyvenv venv source venv/bin/activate pip3 install -r requirements.txt python3 server.py deactivate -关闭本地环境安装新套件pip3 ...
ncbi查找目的基因序列_使用NCBI设计qPCR引物方法
weixin_39964528的博客
01-02 4699
对于分子生物学的研究者来讲，NCBI是科研过程中的一大神器，我们不仅可以在其中查找基因组、基因、蛋白，还可以在其中进行文献查找、序列比对等操作，连设计引物的功能NCBI也给我们构建好了，名字叫做Primer designing tool或者Primer-BLAST。并且，基于NCBI庞大的数据库信息，可以实现对引物扩增特异性的预测，甚至直接设计出特异性良好的qPCR引物(预测值)。这也是NCBI相...
【经验分享】NCBI设计引物——最详细说明及教程！！！适合0基础~
热门推荐
m0_61164319的博客
10-22 2万+
还不会用NCBI设计引物？还不知到NCBI调整哪些参数？这篇文章将给你最全面的解释【适合新手，老手也可以自我验证】
如何设计qPCR引物序列
weixin_47745419的博客
11-17 1万+
qPCR引物序列设计
qPCR引物设计的骚操作，你get到了吗？
最新发布
qihengxing123的博客
12-29 720
6. 验证完之后就可以送公司进行合成啦，当然我们还需要做最后一步工作，就是引物的PCR验证，特别是产物特异性的验证，往往我们设计好的引物，在软件中的表现是完美的，但是在实际PCR的时候就会出现非特异性扩增的问题，这里面有可能是引物本身的原因，也有可能是试剂的原因，配置体系，盐离子浓度等等。而好的试剂是解决非特异性扩增的有利助手，启衡星Starligter SYBR qPCR Mix经过N轮的配方优化，帮您很好的解决了非特异性扩增的问题，为您简化引物设计及验证的流程，节省您的时间及成本！
生信-使用NCBI进行目的基因的引物设计
lietobrain's blog
11-17 7986
使用NCBI进行目的基因的引物设计 全文概述 利用生信工具进行目的基因的引物设计，使用了NCBI进行筛选与设计引物，使用 idtdna对筛选出的DNA进行检查。本文分享了如何筛选出高质量的基因引物，帮助想通过生信进行引物设计的学生、从业者找出合适的基因，毕竟购买引物也比较烧钱，避免设计出的基因质量偏低。 NCBI查找基因 1.查询目的基因：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/...
数据库推荐，qPCR引物设计与评价
leroylee7的博客
11-22 1000
我们在做qPCR的时候首先需要的就是设计引物。设计引物的软件有很多的。而这次介绍的这两个 MRPrimerW2是一个用来设计引物的软件。 MFEprimer是一个可以用来评估引物质量的数据库。 数据库地址见文末 MPRrimerW2 MPRrimerW2支持九个物种的引物设计网站。我们可以通过输入基因名/fasta序列格式来设计引物的数据库。 另外这个网站可以一下子输入很多的基因，来一次性的设计很多基因的引物。 同时网站对于引物的自定义还有更近一步的设置。这个方便我们设计出...
引物设计学习笔记.docx
07-19
本笔记主要介绍了两种PCR技术的引物设计方法，包括普通PCR（RT-PCR）和实时荧光定量PCR（QPCR）。 1. **普通PCR（RT-PCR）引物设计** - 使用的软件主要有Primer 5和Oligo 7。 - 设计流程包括查找目的序列，通常在...
pokay:报告针对一组病原体分离基因组的显着qPCR引物探针或免疫表位错配信息
03-05
报告针对一组病原体分离基因组的显着DNA（qPCR引物/探针）或氨基酸（表位）不匹配信息。 发音 / poʊˈkeɪ /（如 ，或Pokay（如“我的PCR设计还可以”或“我的表位还可以”）。 动机 我的PCR分析设计是否可以检测...
Real-time PCR 引物设计工具-Primer Express 3.0
05-01
Primer Express 3.0是一款专为实时PCR设计引物的软件，尤其适用于ABI的qPCR系统。该软件提供了多种高级功能，帮助研究人员在设计引物时考虑多种因素，确保引物具有最佳性能： 1. **目标区域选择**：用户可以输入...
引物设计步骤
05-26
关于从NCBI相关网站上下载基因组序列，以及其他序列的基本步骤，以及相关信息，还有利用相关软件设计引物的方法，步骤详尽，用于初学者。
Primer Express 3.0引物探针设计软件.rar
09-04
Primer Express是BI附着的一款用于设计引物和探针、荧光PCR探针的设计软件，能够精确计算寡核苷酸与荧光基团鳌合后的Tm值。可以预测引物与引物之间与模板之间等的二级结构。本版本为3.0版，在XP系统下能够正常使用...
生物信息学常用软件—2（PCR引物设计及相关软件使用）
xcaryyz的博客
02-05 7247
原文：http://blog.csdn.net/shmilyringpull/article/details/7342277 lPCR引物设计及相关软件使用 主要内容 1、背景 2、PCR引物设计原则 3、常用PCR引物设计软件 4、Primer Premier 5.0 介绍 5、Oligo 6.44介绍 6、在线Primer3 介绍
引物的设计及修饰最全教程
leroylee7的博客
11-29 5327
1. 引物设计的基本原则是什么？ 引物设计的下列原则供您参考： 1) 引物最好在模板cDNA的保守区内设计。 2) 引物长度一般在15-30碱基之间。 3) 引物GC含量在40%-60%之间，Tm值最好接近72℃。 4) 引物3′端要避开密码子的第3位。 5) 引物3′端不能选择A，最好选择T。 6) 碱基要随机分布。 7) 引物自身及引物之间不应存在互补序列。 8) 引物5′端和中间△G值应该相对较高，而3′端△G值较低。
使用linux批量引物设计,干货分享：如何快速设计多条qPCR引物？
weixin_42633137的博客
05-13 742
原标题：干货分享：如何快速设计多条qPCR引物？ 干货分享：小伙伴们，新的一周已经开始啦，有没有从周末中复苏过来，今天首先让我们来了解一款快速设计多条qPCR引物的数据库。MRPrimer使用篇qPCR成为诊断检测等多种技术手段的有利工具，在一个实验中，往往我们要设计多条qPCR引物，在多条引物的设计过程中，我们需要考虑引物之间的干扰等多种问题，目前已知的多种引物设计工具有尚有很多不足，比如需要耗...
NCBI基本引物设计、（初学者）
kunxitoothache的博客
03-22 4218
首先你得知道有个网站叫ncbi：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/能做好多事情，今天我们用它来做点事 基础引物设计 blast→ primer-blast→ 放入序列，设置引物位置 调整产物大小 其他设置 然后do it
（在线）设计引物
immortalF的博客
11-18 3701
方法一、通过primer bank 1、输入需要设计引物的基因或者序列（here），选择相应的基因名类型以及物种名，然后点击submit 2、尽量选择含有Validation Results的引物选项（有实验验证），Tm值在60左右 点开Validation Results查看实验结果，图示单峰值可用于后续验证，多峰值则无法使用！！！ 3、合适的序列然后在NCBI中进行blast-->Nucleotide 把一条引物序列输入后,查看是否有选项需要改变，然后blast
QT属性动画--设置样式属性(其他属性)
lizequan的博客
03-02 6439
这里写自定义目录标题故事背景遇到的问题解决过程最终方法感悟 故事背景   最近在制作一个按钮切换的动画特效中接触了属性动画这部分内容，并由此产生了一些思考。 遇到的问题 解决过程 最终方法 感悟 ...
引物设计指南：Primer5与Oligo7教程
"引物设计是分子生物学实验中的关键步骤，主要涉及PCR（聚合酶链式反应）和QPCR（实时荧光定量PCR）技术...在整个设计过程中，不仅要有理论知识的支撑，还需要实践经验的积累，不断优化引物设计，以提高实验的成功率。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

如期生物

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值
>