来源: “码农不会写诗”公众号
链接:Lammps命令学习-3之boundary
boundary x y z
设置全局模拟框的边界条件。
https://docs.lammps.org/boundary.html
Syntax
boundary x y z
Description
设置全局模拟框的边界条件,若参数值为一个字母如p,则为模拟框的下表面和上表面指定相同的样式p;若为两个字母如pf,则将第一个样式p指定给下表面,将第二个样式f指定给上表面。
boundary x y z
x,y,z = p or s or f or m, one or two letters
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p : periodic,周期性,粒子可以在边界上相互作用,当粒子从长方体的一端退出时,则在另一端重新进入盒子。 注:对于二维模拟,z维度必须是周期性的(默认值即为p)。
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f : non-periodic and fixeds,模拟框面的位置是固定的,即如果一个原子移动到模拟框外,那么在下一次更新近临表时将会被删除,此时将会报出原子丢失错误,但若想允许此情况发生而不报错,可以设置thermo_modify lost选项以允许原子丢失。
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s : non-periodic and shrink-wrapped,设置模拟框面的位置为包含该维度中的原子(shrink-wrapping),无论原子移动多远。需要注意的是,这在当前盒子尺寸和shrink-wrap的盒子尺寸之间差值较大时、且在并行运行时,在刚开始模拟时可能会出现丢失原子现象。
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m : non-periodic and shrink-wrapped with a minimum value,如-s值一样会进行shrink-wrapping,但会受如create_box命令指定的或从data文件中读取的盒子大小的限制。如果希望在模拟盒的一侧留出空间(例如原子从表面蒸发等),则此参数值会很合适。
Example
boundary p p f
boundary p fs p
boundary s f fm
Default
boundary p p p
书山有路勤为径,学海无涯苦作舟。今天就到这里啦,拜了个拜~