【LAMMPS学习】八、基础知识(1.2)可视化 LAMMPS 快照

本文讲解LAMMPS的基本操作,如重启模拟、使用dump命令生成快照,并介绍如何通过OVITO和VMD进行可视化。还提及了数据转换工具的使用。
摘要由CSDN通过智能技术生成

8. 基础知识

此部分描述了如何使用 LAMMPS 为用户和开发人员执行各种任务。术语表页面还列出了 MD 术语,以及相应 LAMMPS 手册页的链接。 LAMMPS 源代码分发的 examples 目录中包含的示例输入脚本以及示例脚本页面上突出显示的示例输入脚本还展示了如何设置和运行各种模拟。

 8.1.通用基础知识

8.1.1.重新启动模拟 

8.1.2.可视化 LAMMPS 快照

可以通过多种方式查看、可视化和分析 LAMMPS 模拟的快照。

LAMMPS 快照是通过 dump命令创建的,该命令可以创建多种格式的文件。

原生 LAMMPS 转储格式是一个文本文件(请参阅“转储原子”或“转储自定义”),可以通过多种 MD 模拟轨迹可视化工具对其进行可视化。

OVITOVMD似乎是其中最受欢迎的选择。

转储图像和转储电影样式可以输出内部渲染的图像或在 MD 运行期间将其转换为电影。

LAMMPS 附带的程序作为辅助工具可以在 LAMMPS 格式文件和其他格式之间进行转换。有关详细信息,请参阅工具页面。现在很少需要这些了。

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