基于药效团的虚拟筛选技术发现全新转化因子β受体1拮抗剂

摘要：作为治疗恶性肿瘤的新药，转化生长因子β受体1（TGFβR1）拮抗剂获得了广泛关注。作者基于TGFβR1-BMS22的复合物晶体结构和文献报道了抑制剂数据构建了两个药效团模型A02和B10。应用这两个药效团模型，作者虚拟筛选了DruglikeDiverse、MiniMaybridge和Zinc Drug-like等数据库，发现了两种全新的TGFβR1拮抗剂骨架。并将筛选出的化合物经过类药五规则和ADMET性质预测。最终化合物YXY01-03具有新颖的骨架，良好的药物性质，潜在的活性，可能比BMS22具有更高的安全性，这可能对进一步的研究有价值。

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药效团模型（Pharmacophore）：是指药物活性分子中对活性起着重要作用的“药效特征元素”及其空间排列形式，可以认为是大量活性化合物共同的成药特征。基于药效团模型，科研人员可以进行快速的药物虚拟筛选工作，寻找结构新颖的活性分子；也可以解释化合物的构效关系，进行化合物的结构优化与改造；此外，还可以进行化合物靶标的识别，实现反向找靶。Discovery Studio中的Catalyst模块，是经典的药效团模型生成、验证及虚拟筛选的工具，可以基于配体、受体以及复合物结构进行定量、定性的药效团模型研究。

基于药效团的虚拟筛选技术发现全新转化因子β受体1拮抗剂

ref：Molecules. 2018 Oct 31;23(11). pii: E2824；IF=3.06

链接： doi: 10.3390/molecules23112824

作为治疗恶性肿瘤的新药，转化生长因子受体1（TGFβR1）拮抗剂获得了广泛关注。作者首先对TGFβR1-BMS22复合物结构6B8Y，应用DS_Receptor-Ligand Pharmacophore Genereation模块，生成基于结构的药效团。然后收集了文献里17个具有TGFβR1抑制活性的化合物，使用DS_Common Feature Pharmacophore Generation模块，生成基于配体的药效团。值得一提的是，基于配体的药效团生成时分子构象是采用对接的构象构建三维药效团模型。经过87个测试集分子和8677个诱导集分子共同测试两个药效团模型发现，A02和B10表现更好，可以用于后续虚拟筛选。作者针对DruglikeDiverse、MiniMaybridge和Zinc Drug-like等数据库，发现了两种全新的TGFβR1拮抗剂骨架。并将筛选出的化合物经过类药五规则和ADMET性质预测。最终化合物YXY01-03具有新颖的骨架，良好的药物性质，潜在的活性，可能比BMS22具有更高的安全性，这可能对进一步的研究有价值。

 

图一 筛选出的4个化合物与药效团模型A2的匹配图