基于对虚拟筛选结果挑选的规则----Sybyl

基于对虚拟筛选结果挑选的规则----Sybyl

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1. 根据对接打分Total Score，挑选TS>8.0分的化合物；

2. 基于TS>8.0,从对接得到的构像（默认20个）中挑选Cscore≥4的化合物；

3. 2.1 统计TS>8.0,CS≥4的构型所占的比例，如7/20；

4. 2.2 计算这些构型的平均分；

5. 2.3 统计这些构型在各个分段下的分布，如10-11分3个；

6. 2.4 统计这些构型的RMSD值；

7. 观察并记录这些构型与蛋白之间的相互作用，挑选出与主要残基作用的化合物；

8. 生成蛋白surfaces，观察这些构型在surfaces中的趋势；

9. 观察并记录这些构型与蛋白中原配体的相似性，如形状相似性，药效相似性，分子弯曲可改造性等；

10. 综合以上参数，得到第一批结果result1；

11. 将所得的结果得到一个表单，用相同的方法进行二次对接，排除TS低于8.0分的构型，得到第二批结果result2

12. 对比result1和result2的各个化合物在各分段出现的稳定性，如result1中A化合物TS为11分，在result2中TS为8分，可考虑先排除；