生物数据库建设,等你来~

高通量测序技术的发展使得数据的获取越来越容易,数据也累计越来越多;

生物信息的发展为解析数据提出假说提供了很好的技术手段;

数据有了,分析结果有了,文章发表了,皆大欢喜。

然后呢?为我们出力的数据怎么处理?

鸟尽弓藏,兔死狗烹?

让他们蜷缩在Excel里? 让他们沉睡在服务器上?

还是提供个在线平台让数据好好组织起来,更方便实验室以后的查询、分析和使用?

或者也可以成为自己研究的小领域的标准库?

抑或是发表一篇10分的NAR文章?

下面就是2个很好的例子。

一个是中医药方剂的数据库,收录方剂、药材、靶点、疾病、通路等信息,网站古色古香,设计精美,交互探索,网络大气,于2018年发表于NAR杂志。

表格展示太枯燥,关键信息交互式饼图展示,查看,点击筛选~~

现在数据库升级第二版,更多功能,更多展示 (网络图比下面这个更漂亮,更有生物意义,更有交互性,只是暂时还不能释放 o(╥﹏╥)o)。

另一个是Prophage hunter,在细菌基因组中寻找活性噬菌体。页面极简,定制基因组浏览器交互,于2019年发表于NAR杂志。

表格和基因组浏览器的双向控制

做的更多的还是分子数据的展示,如转录组相关数据的展示。

首先展示下首页,专业设计师私人定制,可以传统,可以现代;可以功能为主,也可以轮播酷炫。

  • 首页搜索框全局搜索,类似谷歌,输入基因名、通路名、功能关键词皆可搜索。

  • 小轮播展示网站可做的分析和结果展示,差异基因富集全套,还是交互式的。

  • 四个饼图联动展示数据库收录的样品和属性信息,高端大气显地位。

那搜索一下,都展示哪些信息?基因,别名,公共数据库链接,功能注释,表达分布,PPI网络,共表达网络,想放啥放啥!

一个基因嫌少,来绘制一组基因的表达谱,修饰谱;同时展示甲基化修饰与基因表达的关系。

搜索太简单了(其实功能很强大),可否更多条件搜索?

多组学如何展示?基因组浏览器可否嵌入?

基因组浏览器是多组学的展示利器,更多见:

ChIP类数据同时展示IP, Input样品丰度 (这个双峰图可拆可合)和peak信息,见下图。

展示同源物种,也可以~

来点更多在线功能,样品聚类、筛选、差异基因(样品特异性基因)、功能富集

更多交互式图,染色体图谱、饼图、箱线图、交互式表

数据库收录样本信息还有另外展示方式

这也是一个主页风格,随您定制。

更多地图展示

时间轴变化来一个

访问量统计页来一个

以上列出一部分,更多数据库还在建设中,发表后慢慢释放,更多展示和需求也等您提出。

按捺不住了,来易汉博-生物信息数据库和网站建设-专业团队。

1、资源项目源码均已通过严格测试验证,保证能够正常运行; 2、项目问题、技术讨论,可以给博主私信或留言,博主看到后会第一时间与您进行沟通; 3、本项目比较适合计算机领域相关的毕业设计课题、课程作业等使用,尤其对于人工智能、计算机科学与技术等相关专业,更为适合; 4、下载使用后,可先查看README.md或论文文件(如有),本项目仅用作交流学习参考,请切勿用于商业用途。 5、资源来自互联网采集,如有侵权,私聊博主删除。 6、可私信博主看论文后选择购买源代码。 1、资源项目源码均已通过严格测试验证,保证能够正常运行; 2、项目问题、技术讨论,可以给博主私信或留言,博主看到后会第一时间与您进行沟通; 3、本项目比较适合计算机领域相关的毕业设计课题、课程作业等使用,尤其对于人工智能、计算机科学与技术等相关专业,更为适合; 4、下载使用后,可先查看README.md或论文文件(如有),本项目仅用作交流学习参考,请切勿用于商业用途。 5、资源来自互联网采集,如有侵权,私聊博主删除。 6、可私信博主看论文后选择购买源代码。 1、资源项目源码均已通过严格测试验证,保证能够正常运行; 2、项目问题、技术讨论,可以给博主私信或留言,博主看到后会第一时间与您进行沟通; 3、本项目比较适合计算机领域相关的毕业设计课题、课程作业等使用,尤其对于人工智能、计算机科学与技术等相关专业,更为适合; 4、下载使用后,可先查看README.md或论文文件(如有),本项目仅用作交流学习参考,请切勿用于商业用途。 5、资源来自互联网采集,如有侵权,私聊博主删除。 6、可私信博主看论文后选择购买源代码。
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