linux系统安装和使用TM-align

TM-align 是一个用于蛋白质结构比对的命令行工具，广泛用于计算两个蛋白质链之间的结构相似性，通常输出 TM-score 来衡量这种相似性。以下是 TM-align 的安装和使用步骤。

1. 下载和安装 TM-align

1.1 在 Linux上安装

1. 下载源代码 打开终端，进入你希望安装 TM-align 的目录，然后运行以下命令下载源代码：

wget https://zhanggroup.org/TM-align/TMalign.cpp

1.2. 编译代码 

使用 g++ 编译下载的 TMalign.cpp 文件：

g++ -O3 -ffast-math -lm -o TMalign TMalign.cpp

• 这将生成可执行文件 TMalign，可以在当前目录中直接使用。

• 也可以将 TM-align 添加到系统路径 为了在任何地方运行 TM-align，可以将它的路径添加到环境变量 PATH 中：

export PATH=$PATH:/path/to/TMalign

2. 使用 TM-align

TM-align 的使用非