蛋白质SCOP数据库介绍

SCOP（Structural Classification of Proteins）数据库和CATH数据库是两种常用的蛋白质结构分类系统，它们通过不同的方法对已知的蛋白质三维结构进行分类，帮助研究人员理解蛋白质的进化关系和功能。

SCOP数据库简介 SCOP| Structural Classification of Proteins

SCOP（Structural Classification of Proteins）是一个基于蛋白质三维结构的手工分类系统，由研究者通过分析蛋白质结构的相似性和进化关系手动构建。SCOP的分类层次如下：

1. 家族（Family）：基于高序列相似性，将具有相似结构和功能的蛋白质放在一起。
2. 超家族（Superfamily）：即使序列相似性较低，但仍然推测具有共同进化起源的蛋白质结构会被归类为同一超家族。
3. 结构域（Domain）：SCOP中的基本分类单元，代表蛋白质结构中能够独立折叠且具有功能的部分。
4. 层次（Hierarchy）：从细节到广义分为家族、超家族、折叠（fold）和等级。

SCOP每隔一段时间手动更新一次，旨在通过结构和功能上的相似性对蛋白质进行更精细的划分。

CATH数据库简介