复现《Cell stem cell》图表 STRING互作分析+igraph绘制大型蛋白互作网络图

已于 2022-12-05 10:35:35 修改
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文章标签： STRING igraph 蛋白互作网络 富集分析
于 2022-12-05 10:29:57 首次发布
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这是发表在《Cell stem cell》上的一篇文章，这里展示的是蛋白之间的互作网络。用图片查找，发现这种分析可视化并没有用烂，只找到了一篇《Scientific reports》，那么你想做一个与众不同的基因或者蛋白互作分析的话，乘着还没有发现，赶紧做起来吧！这图放在文章中绝对拉风！！！

（Nicotinamide Ameliorates Disease Phenotypes in a Human iPSC Model of Age-Related Macular Degeneration）

作者简单描述了分析过程： 

我们根据作者的方法描述，从最源头开始，差异的蛋白或者基因分析这里跳过，直接使用现成的数据，从STRING互作分析开始，直到igraph分析和可视化结束，最后对模块基因富集分析，用AI标注就完成了。我们使用的数据完成的效果如下：

TS的美梦
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