EPISuite | 化合物物理化学性质查询网页及软件

一、 软件介绍及下载安装

1.1 软件介绍

EPI Suite™-Estimation Program Interface官方主页介绍。

该套件是由美国 EPA与 Syracuse Research Corp. (SRC)开发，用于测定化合物的物理化学性质及环境归趋的软件。
同时，该套件还包含可以用于预测水生毒性的ECOSAR™程序。

1.1.1 软件所含模型

KOWWIN™：使用原子/碎片贡献方法估算化学品的辛醇-水分配系数 log KOW。
AOPWIN™：估算最常见的大气氧化剂、羟基自由基和化学品之间反应的气相反应速率。还估计了烯烃和乙炔的气相臭氧自由基反应速率。
HENRYWIN™：使用基团贡献和键贡献方法计算亨利定律常数（空气/水分配系数）。
MPBPWIN™：有机化学品的熔点、沸点和蒸气压可通过多种方式估算。
BIOWIN™：使用 7 种不同模型估算有机化学品的需氧和厌氧生物降解能力。
BioHCwin：估算仅含碳和氢（即碳氢化合物）化合物的生物降解半衰期。
KOCWIN™：以前称为 PCKOCWIN™，该程序估算土壤和沉积物的有机碳归一化吸附系数，即KOC。KOC 使用两种不同的模型进行估算：具有改进校正因子的 Sabljic 分子连接方法；基于log KOW的传统方法。

WSKOWWIN™：使用 KOWWIN™ 程序估算辛醇-水分配系数，然后根据该值和适用的校正因子估算化学品的水溶性。
WATERNT™：利用类似于 KOWWIN™ 程序中的“碎片常数”方法直接估计水溶性。
BCFBAF™：以前称为 BCFWIN™，该程序使用两种不同的方法估算鱼类生物富集因子及其对数值。第一种是基于 log KOW 及任何适用校正因子的传统回归，类似于 WSKOWWIN™ 方法。第二种是 Arnot-Gobas 方法，根据机械第一原理计算 BCF。BCFBAF 还结合了对鱼类表观代谢半衰期的预测，并估计了三个营养级的 BCF 和 BAF。
HYDROWIN™：估算酯、氨基甲酸酯、环氧化物、卤代甲烷、选定的烷基卤化物和磷酯的水解速率常数和半衰期：。估算除磷酯外（不是中性水解）的酸和碱催化水解的速率常数。此外，HYDROWIN™ 确定了多种可能显著水解的化学结构类别（例如氨基甲酸酯），并提供相关的实验数据。
KOAWIN：使用来自 KOWWIN™ 的辛醇/水分配系数 (KOW) 与来自 HENRYWIN™ 的无量纲亨利定律常数 (KAW) 之比估算 KOA，即辛醇/空气分配系数。KOA 在化学评估中有多种用途。
AEROWIN™：使用三种不同的方法估算吸附在空气中颗粒物上的空气中物质的比例，即参数 phi (φ)。
WVOLWIN™：估算一种化学品从河流和湖泊中的挥发率；并根据它们的速率计算这两个过程的半衰期。该模型对水体深度、风速等做出了某些默认假设。

STPWIN™：该程序预测在典型的基于活性污泥的污水处理厂中化学物质的去除。给出了总去除率和可能有助于去除率的三个过程的值：生物降解、污泥吸附和空气汽提。
LEV3EPI™：该程序包含一个 III 级多媒体逸度模型，并在默认模型“环境”的稳态条件下预测空气、土壤、沉积物和水中的化学物质分配。用户可以更改某些（但不是全部）系统默认值。
ECOSAR™ 1.11 版（2012 年 9 月）：生态结构活动关系 (ECOSAR) 计划估算工业化学品的水生毒性。该计划估计了水生生物对鱼类、水生无脊椎动物和绿藻的急性（短期）毒性和慢性（长期或延迟）毒性，并在数据可获取的情况下对其他咸水和陆地物种的 SAR 有限。该计划由该机构的一个单独部门维护，有关该模型的更多信息可以在 ECOSAR 网页上找到。

1.2 软件下载及安装

EPI Suite™ 4.1软件下载。
下载之后直接双击安装，按照步骤提示进行安装即可（图1）。

图1 安装成功

二、 模型使用

软件安装并打开之后，界面如图2所示。左侧可以看到列出的主要模型列表，任意单击便可进入对应模型的设置界面。

图2 EPI Suite软件界面

2.1 单个模型的使用

以辛醇水系数计算模型（KOWWIN）为例，点击之后，如图3所示，输入化合物的“SMILES”或“NAME”便可对该化合物进行查询。

图3 KOWWIN v1.68模型计算界面

以atrazine为例，输入名字选择“NameLookup”，弹出“Chemical Name Lookup”查询界面（图4）。

图4 Chemical Name Lookup查询界面

输入名字后，会弹出图5的化合物查找列表，可以看到第一个选中的化合物即我们的目标化合物（图5）。

图5 化合物查询列表

点击OK之后，会看到已自动在“SMILES”或“NAME”中填充了库中该化合物的SMILES及名称（图6）。

图6 化合物的SMILES及名字

点击右上角的“calculate”就会自动弹出atrazine的辛醇水系数计算结果（图7）。

图7 atrazine的辛醇水系数计算结果

2.2 多个模型的使用

2.2.1 化合物性质查询网站

在遇到一些需要同时获取化合物多个物化性质时，除了搜索文献及chemicalbook，pubchem，Chemical Dashboard，Chemspider，DrugBank等网页外，也可以利用EPI Suite组件进行一次查询。

2.2.2 EPISuite多个模型的使用

如图8所示，输入CAS号之后，点击“Calculate”会提示必须输入“SMILES”，点击“Search CAS”即可自动补充该化合物的“SMILES”与“NAME”，继而点击“Calculate”便可弹出各个模型的计算结果，一次点击查看即可（图9）。

图8 化合物信息输入

图9 化合物物化性质计算结果

以上是本文的简要介绍，当然也可以自己摸索更多功能！