RMSD与PMSF 解释与区别

我不需要力量源泉 对我来说 这只是需要完成的一件事，我应该一直全力以赴的做下去 放弃不是我的天性，我甚至不在乎乐观还是悲观。
二者都是对位移的平方和再求平方根，最后求得均值。区别在于：RMSD为在同一帧情况下，对不同原子对选定原子的偏差均值；RMFD为同一原子情况下，对不同帧数时原子的偏差均值。

RMSD:Root Mean Square Deviation 均方根偏差

$${\delta }_i$$为某一帧的第i个原子的位置减去参考构象中它的位置（位置偏移量），然后取所有原子的偏移量的平方和，再对原子数N取平均，再开方。
*其中RMSD倾向于在七自由度约束使用。 *

RMSF：Root Mean Square Fluctuation 均方根波动

引入T,与时间有关。根号内项：t时刻某个原子的位置，减去初始时刻它的位置（位置偏移量），再对所取的偏移量的平方和，再对时间平均，开根号。