孟德尔随机化中去除弱工具变量的错误问题:
代码运行问题
根据SNP获取eaf值(效应位点的频率)时,脚本source("gutMR06.SNP2eaf.R")
dat=SNP2eaf(dat)
write.csv(dat, file="exposure.eaf.csv", row.names=F)
报错为“Error in SNP2eaf(dat) : 找不到对象'web0therA1lele'”
解决方法:
是"gutMR06.SNP2eaf.R"程序包里面代码有问题,正确的应是“webOtherAllele”,被写错成了“web0therA1lele”,注意把“0”改成“O”,把“1”改成“l”。来自于大神@啊?没啥