7+双样本孟德尔随机化“得分神器”的双向孟德尔果然名不虚传

今天给同学们分享一篇生信文章“Bidirectional Mendelian randomization analysis of the genetic association between primary lung cancer and colorectal cancer”，这篇文章发表在J Transl Med期刊上，影响因子为7.4。

结果解读：

MR分析结果

在LC到CRC MR分析中，GWAS研究中的4002个整体LC，1176个LUAD和2789个LUSC IVs达到了显著差异（P < 5 × 10 –8 ）。整体LC，LUAD和LUSC IVs数据集分别鉴定出3912个，1122个和2755个非回文序列的IVs（分别在整体LC，LUAD和LUAD IVs数据集中鉴定出90个，54个和34个回文序列）。基于遗传变异位点之间的LD状态，选择了与整体LC，LUAD和LUSC相关的25个，13个和15个独立IVs，没有LD相关性（3887个整体LC，1135个LUAD和2770个LUSC IVs不是LD独立的。r 2 < 0.01，窗口= 500 kb）。使用PhenoScanner数据库（吸烟：rs3999544，rs55781567，rs56113850；饮酒：rs17391694；BMI：rs71658797）去除与混杂因素相关的IVs [31, 32]。最终，作者确定了20个整体LC的遗传IVs，10个LUAD的IVs和15个LUSC的IVs。

整体结肠癌的MR结果

在前向MR中，在整体LC到整体CRC MR研究中，IVW分析揭示了整体LC和整体CRC在遗传水平上存在显著关联（IVW：OR = 1.0026；95% CI 1.0009–1.0043，P = 0.0029；图2A，3A）。简单中位数方法、加权中位数方法、MR-PRESSO方法和MR-RAPS方法均显示了整体LC和整体CRC之间存在显著关联的证据（简单中位数：OR = 1.0035，95% CI 1.0014–1.0057，P = 0.0012；加权中位数：OR = 1.0040，95% CI 1.0020–1.0060，P = 0.0001；MR-PRESSO：OR = 1.0026，95% CI 1.0009–1.0043，P = 0.0080；MR-RAPS：OR = 1.0026，95% CI 1.0013–1.0040，P = 0.0002；图2A）。

LUSC到CRC的MR结果

在对LUSC和整体CRC MR的研究中，作者发现了LUSC和整体CRC之间存在显著的遗传相关性（IVW：OR = 1.0017，95% CI 1.0006–1.0028，P = 0.0022；简单中位数：OR = 1.0025，95% CI 1.0011–1.0039，P = 0.0007；加权中位数：OR = 1.0025，95% CI 1.0011–1.0039，P = 0.0005；MR-PRESSO：OR = 1.0017，95% CI 1.0006–1.0028，P = 0.0084；MR-RAPS：OR = 1.0017ÿ