LIPID11中每个磷脂分子由3个残基组成。当在LEAP程序中加在磷脂的PDB文件时,LEAP程序就可以将分子的头部和尾部连接在一起。为了使LEAP能够正确的识别磷脂分子,
PDB中残基的定义方式应当按照下面的定义方法:
PDB中的每一个磷脂分子的定义:
sn-1 | tail | residue |
head | group | residue |
sn-2 | tail | residue |
TER |
在将PDB载入LEAP的时候,应当将PDB文件中的CONECT信息删除,因为这些信息是冗余的。
LIPID11中每个磷脂分子由3个残基组成。当在LEAP程序中加在磷脂的PDB文件时,LEAP程序就可以将分子的头部和尾部连接在一起。为了使LEAP能够正确的识别磷脂分子,
PDB中残基的定义方式应当按照下面的定义方法:
PDB中的每一个磷脂分子的定义:
sn-1 | tail | residue |
head | group | residue |
sn-2 | tail | residue |
TER |
在将PDB载入LEAP的时候,应当将PDB文件中的CONECT信息删除,因为这些信息是冗余的。