bin:可以理解为参考基因组上的某段区间,用于将整条染色体切割成不同的区间,然后统计每个区间的数据信息。通常表示为染色体号,起始点,终止点。通常可以认为是窗口的意思。
举例:Seurat中AddModuleScore()函数的详细解释是:
将我们感兴趣的基因,抽出来,每个细胞算一下这些基因表达的平均值,背景基因的平均值就是找每个基因所在的bin,在该bin内随机抽取ctrl个基因作为背景,最后将得到的目标基因的平均值,背景基因的平均值两者相减就是每个细胞此基因集对应的score值。
bin:可以理解为参考基因组上的某段区间,用于将整条染色体切割成不同的区间,然后统计每个区间的数据信息。通常表示为染色体号,起始点,终止点。通常可以认为是窗口的意思。
举例:Seurat中AddModuleScore()函数的详细解释是:
将我们感兴趣的基因,抽出来,每个细胞算一下这些基因表达的平均值,背景基因的平均值就是找每个基因所在的bin,在该bin内随机抽取ctrl个基因作为背景,最后将得到的目标基因的平均值,背景基因的平均值两者相减就是每个细胞此基因集对应的score值。