R语言绘制火山图

火山图在转录组分析中运用较多，常用于展示显著表达的差异基因，以下是绘制基础火山图的一个小示例。

1.调取ggplot2包，读取数据文件；

#####火山图
library(ggplot2)

#读取数据
dataset <- read.table('volcano_data.txt',header = TRUE)

2.设置阈值；

# 设置pvalue和logFC的阈值
cut_off_pvalue = 0.01
cut_off_logFC = 1
dataset$change = ifelse(dataset